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Bio_Noob
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14 Messaggi

Inserito il - 14 gennaio 2010 : 19:32:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Bio_Noob Invia a Bio_Noob un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
qualcuno può spiegarmi il concetto di sintenia? perchè non credo di aver afferrato a pieno il significato

ukitel
Nuovo Arrivato



78 Messaggi

Inserito il - 14 gennaio 2010 : 20:37:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ukitel Invia a ukitel un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Il termine sintenia indica semplicemente la condizione dei locus genici che si trovano sullo stesso cromosoma.

Quindi 2 locus genici sono sintenici se sono stati assegnati allo stesso cromosoma, ma non necessariamente in linkage.

Chiarifico quest'ultima parte: siccome il linkage genetico viene definito come una frequenza di ricombinazione inferiore a quella attesa, capirai che 2 geni su uno stesso cromosoma (e quindi sintenici) possono apparire come non linked, poiché mediamente si verificano 3 crossing-over per cromosoma.

Il concetto può anche essere allargato al confronto tra specie diverse: in questo caso si parla di sintenia condivisa e non ci si riferisce a geni sullo stesso cromosoma, perché, ovviamente, i cromosomi sono unici per ogni specie, bensì al loro preciso ordine sul cromosoma.

La conservazione di tale ordine può sottintendere relazioni tra i geni: per esempio possono condividere la stessa regione regolatoria, sono vantaggiosi se ereditati insieme e così via.

Da questo punto di vista è facile capire che ricercare regioni di sintenia condivisa tra specie è un modo efficientissimo di trovare geni ortologhi.

Infine una curiosità... In tutti gli animali, i geni Hox, che sono essenziali per indirizzare lo sviluppo delle strutture corporee, sono ordinati sul cromosoma in un cluster secondo l'ordine di tali strutture sul corpo: da testa verso coda.
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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 15 gennaio 2010 : 11:59:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
bella risposta!

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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