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 individuare la progenie sapendo le u.m.
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Ips-Iups
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Inserito il - 26 maggio 2010 : 11:53:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ips-Iups Invia a Ips-Iups un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve ragazzi, vi proponiamo un esercizio che ci dà un po di problemi...
Una pianta diploide con geni A,B,C disposti in tale modo
A___________B_______________C
   20 u.m.      30 u.m.

assumendo che non vi sia interferenza, incrociando Abc/aBC x abc/abc, individuare le classi genotipiche nella progenie e la loro frequenza su 1000 piante.

abbiamo provato a risolverlo in questo modo:
dati i gameti A b c & a B C abbiamo individuato i
Parentali: Abc
   "     : aBC
Ricombinanti: AbC
   "        : aBc
   "        : ABc
   "        : abC

Doppi Ricomb: ABC
   "        : abc


dopo di che determiniamo le frequenze di:
Doppi ricombinanti: 0.2 x 0.30= 0.06 =6%
Ricombinanti zona I:(0.2 x0.70)=0.14=14%
Ricombinanti zona II:(0.3x0.80)=0.24=24%
Parentali:(0.70x0.80)=0.56=56%
su una progenie di 1000 individui avrò
Doppi ricombinanti:60 individui
Ricombinanti zona I:140 individui
Ricombinanti zona II:240 individui
Parentali:560
ma non ci troviamo e abbiamo molti dubbi.
HElp perfavore!!!????

Parauallr
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Città: Nocera Inf. (SA) - Roma


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Inserito il - 26 maggio 2010 : 12:44:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Parauallr Invia a Parauallr un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Premetto che i doppi ricombinanti sono ABc e abC. I calcoli mi sembrano corretti. Potresti scrivere i risultati dell' esercizio?
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Ips-Iups
Nuovo Arrivato



40 Messaggi

Inserito il - 26 maggio 2010 : 12:59:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ips-Iups Invia a Ips-Iups un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
si certo...
Abc= 274 individui
aBC=274 individui
ABC=76 individui
abc=76 individui
AbC=126 individui
aBc=126 individui
ABc=24 individui
abC=24 individui
i risultati sono questi...
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Parauallr
Nuovo Arrivato


Città: Nocera Inf. (SA) - Roma


92 Messaggi

Inserito il - 26 maggio 2010 : 18:46:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Parauallr Invia a Parauallr un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Interferenza di sta ceppa... beh vedo se riesco a risolverla formalmente sta cosa... comunque, fondamentalmente il problema è che, come saprai, per valori superiori a 10 cM si creano delle discrepanze non trascurabili tra cM e frequenza di ricombinazione... Ma siccome non sono un biotech, ma studio medicina, non ho mai approfondito granchè sta cosa... vedo cosa riesco a fare :P
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Ips-Iups
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40 Messaggi

Inserito il - 27 maggio 2010 : 10:08:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ips-Iups Invia a Ips-Iups un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
leggendo vari libri,abbiamo trovato diversi metodi per risolvere tale problema ma ovviamente tutti questi non seguono lo stesso ragionamento...oltre al modo che abbiamo proposto prima, eccone un altro:

I fase:il numero di crossing-over doppi che ci si aspetta che compaiano nella progenie è 0.3x0.2x1000=60 equamente suddivisi tra i due tipi di doppi crossing-over cioè(30).
II fase:la p. che un crossing-over singolo si verifichi nella prima regione è del 10%. la p.combinata che il crossing-over non avvenga nella I regione e avvenga nella seconda è
100-20=80/100=(0.80x.30x1000)=240 equamente suddivisi fra le due classi cioè(120).
III fase:similarmente la p. che un crossing-over avvenga nella prima regione e non nella II sarà: (0.20x0.70x1000)=140 ossia 70 per una classe e 70 per l'altra.
IV fase:la p. che ne nella I e ne nella II fase avvengano crossig-over doppi sarà:(0.70x0.80x1000)=560 equamente suddivisi per le due classi.
ti trovi anche tu?
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Parauallr
Nuovo Arrivato


Città: Nocera Inf. (SA) - Roma


92 Messaggi

Inserito il - 27 maggio 2010 : 10:41:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Parauallr Invia a Parauallr un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si certo sono d'accordissimo... quello su cui stavo però riflettendo è che sia i risultati tuoi, che quelli del tuo libro, se fai una prova del 9, si ritrovano perfettamente con il risultato. Anzi, a dir la verità ci sarebbero infinite soluzioni per un esercizio del genere...
Ad esempio, prova:
Abc= 260 individui
aBC=260 individui
ABC=90 individui
abc=90 individui
AbC=140 individui
aBc=140 individui
ABc=10 individui
abC=10 individui

Ritroviamo le stesse distanze in cM. Quindi anche questo è un possibile risultato. Per questo, ti dicevo prima, credo che anche se il risultato che hai ottenuto tu all'inizio sia quello corretto, introducendo una certa interferenza non trascurabile, puoi ottenere potenzialmente infiniti risultati a seconda del grado di interferenza. Non so se mi sono spiegato.. (a dir la verità non so nemmeno se sto dicendo minchiate, spero di no, insomma...)
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Ips-Iups
Nuovo Arrivato



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Inserito il - 27 maggio 2010 : 10:48:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ips-Iups Invia a Ips-Iups un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
si concordo con te anche perchè in questo caso non ho interferenza...che dire ragioniamo allo stesso modo e speriamo che nessuno dei due si sbagli...grazie mille per l'aiuto e il confronto di idee
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Parauallr
Nuovo Arrivato


Città: Nocera Inf. (SA) - Roma


92 Messaggi

Inserito il - 27 maggio 2010 : 10:59:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Parauallr Invia a Parauallr un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma grazie a te Effettivamente stavo cercando qualcosa da portare come approfondimento all'esame di genetica... mi hai dato un buonissimo spunto
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Ips-Iups
Nuovo Arrivato



40 Messaggi

Inserito il - 27 maggio 2010 : 11:05:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ips-Iups Invia a Ips-Iups un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
prego!
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 27 maggio 2010 : 23:23:25  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Molto strana questa cosa, ma questo esercizio dov'è? Su un libro?
Con qualunque metodo lo risolviate i risultati corretti sono quelli che avete scritto voi:
Parentali: 560 (280 ognuno)
Ricombinanti I: 140 (70 ognuno)
Ricombinanti II: 240 (120 ognuno)
Doppi Ricombinanti: 60 (30 ognuno)

Se ottieni invece quei risultati:
Citazione:
Abc= 274 individui
aBC=274 individui
ABC=76 individui
abc=76 individui
AbC=126 individui
aBc=126 individui
ABc=24 individui
abC=24 individui

è perchè c'è interferenza, in questo caso è interferenza positiva in quanto il numero di doppi ricombinanti è minore rispetto all'atteso. L'interferenza è di 0,2 (20%)
Nel caso che invece ha scritto Parauallr
Citazione:
Abc= 260 individui
aBC=260 individui
ABC=90 individui
abc=90 individui
AbC=140 individui
aBc=140 individui
ABc=10 individui
abC=10 individui

l'interferenza sarebbe del 70%.

Ovviamente tutti questi casi ti danno la stessa distanza di mappa tra i 3 geni (A-B 20u.m. e B-C 30u.m.) perchè quelle non cambiano.

Insomma... in ogni caso c'è interferenza, se il testo dell'esercizio è quello i risultati non possono essere quelli ma sono giusti quelli che avete calcolato voi.
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Ips-Iups
Nuovo Arrivato



40 Messaggi

Inserito il - 28 maggio 2010 : 09:36:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ips-Iups Invia a Ips-Iups un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie 1000 per il tuo interesse...comunque l'esercizio è preso da un libro che forse tutti voi conoscono il Suzuki di genetica e nel quesito a noi proposto è senza interferenza...
Grazie ancora per la conferma alla nostra soluzione e al nostro ragionamento!
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