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Geeko
Utente
Città: Milano
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 Inserito il - 30 agosto 2011 : 10:55:27
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Credo proprio si tratti di una ChIP con anticorpi anti-metilazione su quelle basi. Dopo fissaggio la cromatina viene frammentata per sonicazione, e i frammenti ottenuti vengono incubati con l'anticorpo specifico. Ora il mio dubbio è se in questo caso i frammenti debbano prima essere purificati dalle proteine istoniche e non; perché queste potrebbero "coprire" i siti metilati rendendoli inaccessibili all'anticorpo..
I passaggi successivi sono gli stessi di una qualunque ChIP, cioè precipitazione dei frammenti d'interesse grazie agli anticorpi (legati a biglie), loro purificazione e analisi successive (che vanno da un Southern, una PCR o direttamente il sequenziamento (ChIP-seq), o ancora una "ChIP on chip" su di un microarray per l'identificazione in parallelo dei geni coinvolti. |
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