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supererry
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82 Messaggi

Inserito il - 26 novembre 2011 : 14:38:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di supererry Invia a supererry un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti, sto facendo una quantificazione dell'intensità per cellula di una proteina marcata tramite immunoistochimica (DAB).
tramite imageJ, clicco su ogni cellula e ricevo l'intensità della proteina in quella cellula.

Mi chiedo una cosa: quando faccio la stessa cosa ma con marcatura fluorescente, calcolo il fondo (tutto ciò che non è nelle cellule) e poi lo sottraggo all'intensità di ogni cellula misurata. Ma con marcatura tramite DAB, come faccio a eliminare il fondo dalla mia analisi dato che è misurato tramite scala logaritmica dal programma? (per imageJ il bianco viene misurato 100, il nero 1, per esempio).
Devo aggiungerlo all'intensità delle cellule?

spero di essere stato chiaro...


Grazie a tutti

supererry
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82 Messaggi

Inserito il - 26 novembre 2011 : 15:11:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di supererry Invia a supererry un Messaggio Privato  Rispondi Quotando

dunque, la domanda è: dato che con la fluorescenza sottraggo il fondo per la misura delle intensità, con la DAB aggiungo il fondo alle misure di intensità?

Nero con fluo: 100; bianco con fluo:1
Nero con DAB: 1; bianco con DAB:100
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