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 software predizione epitopi antigenici B e T
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dom
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13 Messaggi

Inserito il - 21 maggio 2013 : 12:38:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dom Invia a dom un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buongiorno a tutti.
Qualcuno saprebbe, per favore, indicarmi degli ottimi software (eventualmente anche a pagamento) che permettano di predire gli epitopi antigenici B e T di una data sequenza amminoacidica?
(Al momento ne sono riuscita a trovare alcuni tra cui http://tools.immuneepitope.org/main/html/tcell_tools.html.)
Grazie.
dom

kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 21 maggio 2013 : 13:44:47  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Usare lo IEDB mi sembra un buon punto di partenza. Spulciando nel mio Mendeley ho trovato questi articoli se può interessare (poi dipende da cosa intendi tu per "ottimi"):

Citazione:
Bublil EM, Proteins. 2007 Jul 1;68(1):294-304. PMID: 17427229.
Schreiber A, J Comput Chem. 2005 Jul 15;26(9):879-87. PMID: 15834923.
Mayrose I, Nucleic Acids Res. 2007;35(1):69-78. PMID: 17151070

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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dom
Nuovo Arrivato



13 Messaggi

Inserito il - 22 maggio 2013 : 08:49:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dom Invia a dom un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie mille per le tue indicazioni; sono state molto utili.
dom
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 22 maggio 2013 : 17:02:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Dimenticavo, c'è anche questa review uscita da poco su PLoS ONE:
Citazione:
Yao B, PLoS One. 2013 Apr 19;8(4):e62249. PMID: 23620816

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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AleXo
Moderatore

OrniAle

Prov.: Estero
Città: San Francisco, California


1550 Messaggi

Inserito il - 22 maggio 2013 : 18:57:33  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AleXo  Invia a AleXo un messaggio AOL Invia a AleXo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
nice review, thanks!

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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 23 maggio 2013 : 08:58:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
sipperò non citano il tool del nostro lab, siamo degli illustri sconusciuti

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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dom
Nuovo Arrivato



13 Messaggi

Inserito il - 24 maggio 2013 : 12:15:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dom Invia a dom un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Gentilissimo. Grazie ancora.
dom
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