sintesi del cDNA

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myamya
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 14 novembre 2015 : 15:04:20

ciao ragazzi

volevo chiedervi:cosa significa che l'estremit� 3' dell'mRNA � SOVRARAPPRESENTATA mentre quella 5' � non rappresentata per cui poi questo problema si supera con random primer al posto dell'oligodT per la sintesi del cDNA?

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 18 novembre 2015 : 10:07:30

Per fare il cDNA devi mettere un primer, se usi un poliT come primer avrai un sacco di cDNA della parte 3' dell'mRNA e poca del 5'. Quinti la parte 3' sar� sovra-rappresentata...


5'-5'UTR-serquenza CDS-poliAAAAAAAAA-3'UTR-3'
                         <-TTTTTTTTT

Se usi i random primer invece avrai una rappresentazione pi� omogenea degli mrna...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...