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 sintesi del cDNA
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myamya
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2 Messaggi

Inserito il - 14 novembre 2015 : 15:04:20  Mostra Profilo Invia a myamya un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao ragazzi
volevo chiedervi:cosa significa che l'estremità 3' dell'mRNA è SOVRARAPPRESENTATA mentre quella 5' è non rappresentata per cui poi questo problema si supera con random primer al posto dell'oligodT per la sintesi del cDNA?

domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1679 Messaggi

Inserito il - 18 novembre 2015 : 10:07:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Per fare il cDNA devi mettere un primer, se usi un poliT come primer avrai un sacco di cDNA della parte 3' dell'mRNA e poca del 5'. Quinti la parte 3' sarà sovra-rappresentata...


5'-5'UTR-serquenza CDS-poliAAAAAAAAA-3'UTR-3'
                         <-TTTTTTTTT


Se usi i random primer invece avrai una rappresentazione più omogenea degli mrna...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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