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 frammentazione DNA e next generation sequencing
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ferjusa
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Inserito il - 03 giugno 2016 : 02:56:45  Mostra Profilo Invia a ferjusa un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti!
Vorrei la nostra opinione sull'approccio da seguire per un esperimento di sequenziamento con la ION torrent, un sequenziatore di seconda generazione,in grado di leggere sequenze fino a 200 pb.
L'idea Ŕ sequenziare il genoma del virus HCV (9000 bp circa) o almeno 3 suoi geni (ognuno di circa 1500 pb).
Come conviene frammentare il DNA in sequenze pi¨ piccole? Quali potrebbero essere le metodiche da seguire? Evitando la sonicazione, la frammentazione enzimatica in cosa consiste? E come Ŕ meglio disegnare i primers?
Grazie mille!!!
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