Papillon: pacchetto python per plot RNA-seq

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Discussione

domi84
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Città: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2017 : 00:29:01

Ciao a tutti.
Se avete fatto una RNA-seq con Galaxy/cuffdiff normalmente potete esplorare i geni usando cummeRbund.
Non conoscendo R ho preferito scrivere un modulo in python: Papillon.
Sul sito https://github.com/domenico-somma/Papillon e' presente il manuale e un tutorial. Siccome e' su pypi si installa facilmente con un

pip install papillon

Se a qualcuno andasse di provarlo, qualsiasi feedback qui o sul sito github e' ben accetto.

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
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