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Lisa.ody
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43 Messaggi

Inserito il - 06 gennaio 2008 : 17:30:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Lisa.ody Invia a Lisa.ody un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ragazzi m serve una mano: chi di voi sa spiegarmi come si possono notare i polimorfismi mediante pcr? i miei appunti sn un po' confusi e insufficenti...il prof ha parlato di VNRT e STR...chi può spiegarmi cosa sono e come funziona?
grazie mille in anticipo

paolo865
Utente Junior


Prov.: Como
Città: Olgiate Comasco


262 Messaggi

Inserito il - 07 gennaio 2008 : 16:55:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di paolo865 Invia a paolo865 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
I Vntr sono polimorfismi di 6-60 pb in tandem, dispersi non uniformemente nel genoma, ma nelle zone peritelomeriche. La loro informatività è data dalle numerose varianti alleliche (data dal diverso numero di ripetizioni in tandem), ma essa è diminuita a causa della loro distribuzione non uniforme nel genoma dal fatto che per le loro dimensioni (>40 kb) non possono essere rilevabili per PCR ma solo tramite SOuthern Blot. Gli STR (microsatelliti) invece sono ripetizioni in tandem di 2-4 pb, disperse uniformemente nel genoma ogni 20 Kb circa. Possono essere rilevati per PCR e sono molto informativi. L'unico problema è dato dallo slippage della taq polimerasi che può rendere difficile la loro genotipizzazione. Per Rilevare pe PCR un STR, basta usare dei primer per le sequenze fiancheggianti le ripetizioni in tandem, di solito in corrispondenza di siti di restrizione (si possono progettare degli anchored primer per esempio). spero di essere stato utile ciao
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