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feuerfrei
Nuovo Arrivato
9 Messaggi |
 Inserito il - 06 maggio 2008 : 20:33:58
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salve, mi sapreste spiegare cosa sono i geni sovrapposti e in che modo si possono sovrapporre?
o in alternativa, mi dite come posso scoprirlo?
grazie :D
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frau_frosch
Utente Junior
Città: Boston
225 Messaggi |
Inserito il - 06 maggio 2008 : 22:55:00
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Sono proprio quello che pensi: geni che condividono una regione del DNA. Solitamente sono trascritti a partire da strand diversi: ad esempio, il gene F8C per il fattore VIII contiene, in un suo introne, un'isola CpG che funge da promotore per il gene F8A. Questo vuol dire che sul filamento opposto questa isola viene utilizzata per far partire la trascrizione: va da sè che gli mRNA immaturi dei due geni contengono una porzione complementare, ma questa regione non è condivisa dagli mRNA maturi, perchè si tratta di un introne di F8C.
Se non erro anche RB1 presenta un meccanismo simile: un suo introne contiene il promotore per un recettore associato a proteina G (trascritto dal filamento opposto).
Addirittura esistono casi di "geni nei geni". In questo caso non hai solo una porzione in comune, ma un gene inizia e finisce all'interno di un altro gene. Caso classico è NF1, che contiene ben 3 geni!
Si tratta comunque di fenomeni rari nel genoma, perchè solitamente sono tipici di regioni ad alta densità genica e sai bene che per noi "HSA" la densità genica è bassa...
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1912 Messaggi |
Inserito il - 06 maggio 2008 : 23:37:59
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frau_frosch per RB1 e' cosi' ,introne 17 ( 72 kb )che viene trascritto in senso opposto
...parole dell Archidiacono 
Che poi volendo pure i mitocontri hanno i geni sovrapposti
...parole mie |
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darkene
Utente Junior
291 Messaggi |
Inserito il - 07 maggio 2008 : 00:07:15
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| anche INK4A/ARF! |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 07 maggio 2008 : 00:28:15
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Citazione:
Messaggio inserito da Patrizio
...parole mie
Comunque è anche una caratteristica di alcuni geni virali!
Possono anche essere sullo stesso strand.
- può essere semplicemente lo stesso gene che da origine a due forme della stessa proteina una più lunga e una più corta (non sto parlando di splicing alternativo!) Ma possono essere presenti due diversi ATG uno più esterno e uno più interno
- oppure possono dare origine a proteine "non omologhe" e questo si ottiene quando ci sono frame di lettura diversi |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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frau_frosch
Utente Junior
Città: Boston
225 Messaggi |
Inserito il - 07 maggio 2008 : 23:26:15
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Patrizio, hai avuto la Archidiacono? :) Io l'ho conosciuta perchè ho fatto tirocinio nel loro dipartimento,anche se il mio prof è Mario Ventura...
Tornando in argomento, due prodotti di splicing alternativo possono definirsi geni sovrapposti? Io li ho sempre considerati unico gene... Anche se la definizione di gene è ormai dibattuta da decenni! Il mio prof (Pesole G, forse qualcuno ha studiato Bioinf dal suo testo :P) sostiene che un gene è "una specifica regione di DNA, la cui trascrizione è regolata da uno o più promotori ed altri elementi di controllo trascrizionale, che contiene l'informazione per la sintesi di proteine e RNA non codificanti funzionali, tra loro correlati per la condivisione di informazione genetica a livello dei prodotti finali".
Per farla breve, lo splicing alternativo a partire da uno stesso promotore dà origine a proteine o RNA che condividono parte di sequenza, per cui in teoria sarebbero lo stesso gene, per cui non geni sovrapposti...chissà! |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 08 maggio 2008 : 00:46:40
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Citazione:
Messaggio inserito da frau_frosch
Tornando in argomento, due prodotti di splicing alternativo possono definirsi geni sovrapposti? Io li ho sempre considerati unico gene... Anche se la definizione di gene è ormai dibattuta da decenni! Il mio prof (Pesole G, forse qualcuno ha studiato Bioinf dal suo testo :P)
Ah Pesole anche io l'ho avuto per un breve corso!!!
Comunque...
Citazione:
Messaggio inserito da GFPina
- può essere semplicemente lo stesso gene che da origine a due forme della stessa proteina una più lunga e una più corta (non sto parlando di splicing alternativo!) Ma possono essere presenti due diversi ATG uno più esterno e uno più interno
io NON mi stavo riferendo allo splicing alternativo! |
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frau_frosch
Utente Junior
Città: Boston
225 Messaggi |
Inserito il - 08 maggio 2008 : 12:07:29
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| Ahah scusami allora! non avevo letto il "non"! il mio quesito allora era perfettamente inutile! |
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