Tassonomia e sequenziamento genomi

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Autore

Discussione

RNA world
Utente Junior

370 Messaggi

Inserito il - 24 febbraio 2009 : 18:42:27

ciao a tutti,

come si fa a sapere qual'� l'organismo piu' vicino filogeneticamente al Dissostichus mawsoni e tra questi quale ha il genoma sequenziato o in fase di sequenziamento?
Oppure, da dove si accede alla lista di genomi in fase di sequenziamento, e su questi � possibile fare analisi bioinformatiche?

grazie

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 25 febbraio 2009 : 10:50:20

Purtroppo non credo che esista una lista di genomi in fase di sequenziamento, perche' molti gruppi agiscono per conto proprio. Potresti dare una occhiata a NCBI - genome projects, ma mi sembra che non ci sia quello che cerchi tu :(.

Inoltre, considera che bisogna prendere con le pinze qualsiasi analisi fatta su un genoma nelle prime fasi di sequenziamento, almeno fin quando non si trova a 4-8X di coverage.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

RNA world
Utente Junior

370 Messaggi

Inserito il - 25 febbraio 2009 : 11:31:27

grazie