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fsmedile
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1 Messaggi

Inserito il - 30 giugno 2009 : 17:39:15

ciao tutti ho una domanda per voi:

sto alvorando con seq. di un gene (nasA)(nitrogenase di batteri marini) ho fatto una lib di cloni di 96 seq, ma hanno una similarit� bassissima, volevo tradurre le seq da nucleotidiche in amminoacidiche per poter allinere direttamente le proteine, solitamente uso il MEGA4 con il DNA ma con gli amminoacidi non va molto, quale programma posso usare? considerate che devo passare spessp da DNA a amminoacidi.

grazie in anticipo vi prego aiutatemi....

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 01 luglio 2009 : 10:14:11

Io proverei con CLC Sequence Viewer:
http://www.molecularlab.it/insidebioinfo/?p=66

Pu� passare da Dna a Proteine facilmente, che poi puoi allineare sempre con lo stesso programma.

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...