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Anexunamun
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11 Messaggi |
 Inserito il - 26 gennaio 2010 : 23:16:57
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Ciao, avrei un quesito da porre: Un individuo triplo eterozigote QqPpRr in cis. Sapendo che il gene P è nella posizione centrale e che la distanza tra P e Q è di 15 um e quella tra P ed R è di 5. Determinare quali gameti e con quale frequenza sono attesi; l'interferenza in questa regione è pari a 0,3. ----------------------------------------------------------------------------------
Q P R
============= -------> Eterozigote in cis
q p r
Distanza di mappa (Q-R)= Q + R = 15 + 5 = 20%
Parentali freq. = 100- 20 = 80
Gameti:
P= 80:2= 40 per QPR e 40 per qpr ------> 0,40
RI(Q-P)= 15:2= 7,5 per Qpr e 7,5 per qPR -------> 0,075
RII(P-R)= 5:2= 2,5 per QPr e 2,5 per qpR -------> 0,025
D.R.= 0,15x0,05= 0,0075:2= 0,00375 per QpR e 0,000375 per qPr
Ho un interferenza di 0,3
Quindi I= 1 - COC
COC= N°dei DR OSS : N°dei DR ATT.= X(incognita):0,0075
Lo inserisco nell'interferenza: 0,3= 1- X(incognita):0,0075
Prendo X(incog.) e lo porto al di là dell'uguale con il segno +,
porto 0,3 all'interno con segno - e lascio 1 sempre con segno +,
-0,3 + 1= 0,7 e risposto il denominatore 0,0075 sotto 0,7 facendo la divisione esce 93,3 cioè X=93,3.
E così ho trovato i DR osservati?? Ma mi pare troppo grande come numero!! Ma a cosa mi serve per l'esercizio??
Ho già trovato le mie frequenze senza interferenza e come le posso cambiarle dato che c'è interferenza??
GRAZIE 
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
 Inserito il - 27 gennaio 2010 : 00:52:33
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Sono tutti sbagliati i conti!
Innanzitutto per calcolare i parentali non devi fare 100 - distanza totale come hai fatto perchè così non consideri i doppi ricombinanti.
Poi quando calcoli i singoli ricombinati devi sottrarre i doppi ricombinanti al conteggio.
(quindi devi ricalcolarti tutte le frequenze perchè sono tutte sbagliate)
Infine non so che conti hai fatto per calcolarti i doppi ricombianti osservati, qui mi sono persa:
Citazione:
porto 0,3 all'interno con segno - e lascio 1 sempre con segno +,
-0,3 + 1= 0,7 e risposto il denominatore 0,0075 sotto 0,7 facendo la divisione esce 93,3 cioè X=93,3.
ma ti dovrebbe venire una moltiplicazione e non una divisione.
Ti riscrivo i calcoli:
I= 1 - COC
quindi
COC= 1 - I
se I= 0,3
COC= 1 - 0,3 = 0,7
"COC= N°dei DR OSS : N°dei DR ATT.= X(incognita):0,0075"
risolvi per X e ottieni:
X(incognita)= COC * 0,0075 ( N°dei DR OSS = COC * N°dei DR ATT )
quindi:
N°dei DR OSS = 0,7 * 0,0075
Ti consiglio di riguardarti gli altri esercizi risolti sui geni associati per calcolare le frequenze attese e quelli sull'interferenza per calcolarti le frequenze osservate, ad es:
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=6649
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Anexunamun
Nuovo Arrivato
11 Messaggi |
Inserito il - 27 gennaio 2010 : 11:49:47
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ho scritto chiaramente a lezione che per es. RII sono uguali a 0,05:2=0,025. Stessa cosa con RI=0,15:2=0,075, forse l'unica cosa giusta fatta a lezione, basandomi sul tuo ragionamento è quella dei DR (fatti per ultimi). Ero infatti molto sicura sulle frequenze, mha che strano!! 
ok tornando a noi, ho riprovato a ripeterlo:
Freq. att. dei DR= 0,15 X 0,05= 0,0075
Prendo questi e li divido per 2 : 0,0037 per QpR e 0,0037 per qPr
RI 15% = 0,15-0,0075= 0,14 poi anche quì faccio :2 = 0,071 per Qpr e 0,071 per qPR
RII 5% = 0,05 - 0,0075= 0,042 poi :2 = 0,021 per QPr e 0,021 per qpR
P= 100-0,0075-0,14-0,042= 99,81 : 2 = 49,9 per QPR e 49,9 per qpr
I= 1-COC COC= 1-I I=0,3 COC= 1-0,3=0,7
COC= DR OSS : DR ATT ----> 0,7=X : 0,0075 -----> X = COC X 0,0075
X = 0,0052 che sono i DR OSS
Ma ciò come cambia le frequenze??
Es per RI= 0,14 - 0,0052= 0,13  GRAZIE!!
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 27 gennaio 2010 : 13:05:22
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Attenzione alla differenza tra frequenze espresse come percentuali e come numeri!!!
Non puoi mischiare le cose!
15% come hai scritto giusto nei calcoli è 0,15
5% come hai scritto giusto nei calcoli è 0,05
Ma se esprimi tutto come numeri anche il totale è un numero!
Quindi 100% è 1 non 100!
Quindi il calcolo dei parentali è
Citazione:
Messaggio inserito da Anexunamun
P= 100 1-0,0075-0,14-0,042= 99,81 0,81: 2 = 49,9 0,45 per QPR e 49,9 0,45 per qpr
Infine per il calcolo delle frequenze osservate una volta che hai la freq. osservata dei DR ti calcoli le altre come hai fatto prima semplicemente sostituendo la "nuova" frequenza dei DR alla vecchia.
Quello che hai scritto tu non ha senso perchè hai sottratto sia i doppi ricombinanti attesi che quelli osservati!
Citazione:
Messaggio inserito da Anexunamun
Es per RI= 0,14 - 0,0052= 0,13
0,14 é la freq. dei RI attesi, data da freq. ricombinazione RI - DR-att. e a questa tu hai sottratto anche i DR-oss
Devi semplicemente ricalcolarti le frequenze come prima, quindi:
RI = freq. ricombinazione RI - DR-oss = 0,15 - 0,0052 = 0,15 (approssimando come hai fatto per gli altri)
In realtà forse in tutti i conti hai approssimato un po' troppo e non si vedono le differenze, le frequenze sarebbero queste:
freq. attese freq. osservate
DR 0,0075 0,00525
RI 0,1425 0,14475
RII 0,0425 0,04475
P 0,8075 0,80525
Se vuoi approssimarle almeno mantieni la terza cifra decimale.
Riguardo a questo:
Citazione:
Messaggio inserito da Anexunamun
ho scritto chiaramente a lezione che per es. RII sono uguali a 0,05:2=0,025. Stessa cosa con RI=0,15:2=0,075, forse l'unica cosa giusta fatta a lezione, basandomi sul tuo ragionamento è quella dei DR (fatti per ultimi). Ero infatti molto sicura sulle frequenze, mha che strano!!
In realtà i ricombinanti in prima regione sono 0,15 e questo è vero, nel senso che sono "tutti" quelli che hanno ricombinazione in prima regione, però di questi una parte farà ricombinazione "anche" in seconda regione. Per questo motivo quando calcoli le classi quelli li devi sottrarre.
Forse a lezione ti sei persa il passaggio successivo.
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morgana83
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44 Messaggi |
Inserito il - 27 gennaio 2010 : 13:47:34
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| scusate se mi intrometto, ma GFPina non è che nell'ultima tabella hai confuso i DR con i P? |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 27 gennaio 2010 : 14:42:10
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Citazione:
Messaggio inserito da morgana83
scusate se mi intrometto, ma GFPina non è che nell'ultima tabella hai confuso i DR con i P?
ooopss  hai ragionissima, correggo! |
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Geni concatenati con interferenza
