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 sequenziamento 454 e allineamento dei cloni BAC
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Smichel
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36 Messaggi

Inserito il - 01 maggio 2010 : 18:04:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Smichel Invia a Smichel un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao a tutti,
ho bisogno di un chiarimento sul sequenziamento 454.
dire sequenziamento 454 e Pirosequenziamento è la stessa cosa?
se non lo è mi sapete spiegare il sequenziamento 454?
vorrei anche che mi spiegaste come funziona l'allineamento dei cloni BAC tramite ibridazione e fingerprinting nel sequenziamento gerearchico per definire il tiling path.

Grazie a tutti.

Patrizio
Moderatore

mago

Città: Barcellona


1912 Messaggi

Inserito il - 01 maggio 2010 : 19:24:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Smichel

ciao a tutti,

dire sequenziamento 454 e Pirosequenziamento è la stessa cosa?


Grazie a tutti.



è il metodo di sequenziamento che utilizza la 454


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Smichel
Nuovo Arrivato



36 Messaggi

Inserito il - 01 maggio 2010 : 21:20:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Smichel Invia a Smichel un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
E cosa è la 454?
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Patrizio
Moderatore

mago

Città: Barcellona


1912 Messaggi

Inserito il - 01 maggio 2010 : 21:46:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
un sequenziatore


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Smichel
Nuovo Arrivato



36 Messaggi

Inserito il - 02 maggio 2010 : 10:06:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Smichel Invia a Smichel un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
si ok fin li c'ero arrivato.
Volevo sapere come funzionava.
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Vanilla Sky
Utente Junior




204 Messaggi

Inserito il - 02 maggio 2010 : 11:18:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Vanilla Sky  Rispondi Quotando
Qui magari puoi trovare qualche informazione a riguardo:
http://en.wikipedia.org/wiki/454_Life_Sciences
Citazione:
Technology

454 Sequencing is a large-scale parallel pyrosequencing system capable of sequencing roughly 400-600 megabases of DNA per 10-hour run on the Genome Sequencer FLX with GS FLX Titanium series reagents. The technology is known for its unbiased sample preparation and long, highly accurate sequence reads (400-500 base pairs in length), including paired reads.[citation needed] Software analysis tools, including an assembler, mapper and amplicon variant analyzer, are included with the system.

The system relies on fixing nebulized and adapter-ligated DNA fragments to small DNA-capture beads in a water-in-oil emulsion. The DNA fixed to these beads is then amplified by PCR. Each DNA-bound bead is placed into a ~29 #956;m well on a PicoTiterPlate, a fiber optic chip. A mix of enzymes such as DNA polymerase, ATP sulfurylase, and luciferase are also packed into the well. The PicoTiterPlate is then placed into the GS FLX System for sequencing.
(da Wikipedia)

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Patrizio
Moderatore

mago

Città: Barcellona


1912 Messaggi

Inserito il - 02 maggio 2010 : 23:33:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
usa la funzione "cerca nel sito:"
è già stato spiegato più volte il pyrosequencing


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babilei
Nuovo Arrivato



10 Messaggi

Inserito il - 10 maggio 2010 : 09:25:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di babilei Invia a babilei un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Se vuoi spiegazioni in italiano

http://www.bmr-genomics.it/uht_index.html

Barbara
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