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amicia
Nuovo Arrivato
24 Messaggi |
 Inserito il - 08 giugno 2012 : 10:46:36
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Salve, qualcuno puo indicarmi alcune metodologie, ad eccezione del sequenziamento, per avere un'idea circa le dimensioni del genoma di un organismo come un'alga o un lievito?
Grazie per le risposte
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 08 giugno 2012 : 13:23:37
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Forse un'elettroforesi in campo pulsato applicata sui singoli cromosomi prima separati tra loro?
Ma non ne sono per niente sicuro, aspettiamo gli altri. |
So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 08 giugno 2012 : 15:56:31
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| uhmmmm ma come li separi i cromosomi l'uno dall'altro? |
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 08 giugno 2012 : 16:38:06
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| Leggo su internet che, escludendo il sequenziamento, si può misurare la dimensione di un genoma con la citofluorimetria o densitometria di nuclei colorati con Feulgen. Cercavo qualcosa di + specifico anche sul gene IX, ma stranamente non ho trovato nulla a riguardo. Controllo con + calma + tardi.... |
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 08 giugno 2012 : 16:44:26
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| Avevo letto che si potevano separare tra loro i cromosomi, ma sinceramente non mi ricordo proprio come. |
So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss
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roberta.s
Utente Junior
Città: Parigi
564 Messaggi |
Inserito il - 08 giugno 2012 : 17:11:14
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Dunque dunque... si puo' fare una Pulsed Field Gel Electrophoresis (elettroforesi sul gel in campo pulsato) che permette di separare, tramite elettroforesi su gel d'agarosio, appunto, ed utilizzando specifici parametri di migrazione, frammenti di DNA di diversa lunghezza, in questo caso i cromosomi. dopo la corsa, si visualizzando le bande su gel, se ne determina il peso molecolare e si puo', infine, dedurre la lunghezza totale del genoma.
Di certo questa tecnica non è precisissima, ma ti permetterà di visualizzare tutti i cromosomi. Attenzione pero' ai parametri che usi, perché se due cromosomi hanno simile lunghezza sarà difficile vedere due bande distinte.
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 08 giugno 2012 : 17:17:36
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| ma so che la PFGE può essere applicata ad organismi complessi, che contengono più di un cromosoma? Rimane affidabile? |
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roberta.s
Utente Junior
Città: Parigi
564 Messaggi |
Inserito il - 08 giugno 2012 : 17:43:17
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Abbastanza da vedere grossi riarrangiamenti (grosse delezioni/inserzioni o traslocazioni, ecc), ma ovviamente la risoluzione non è alta.
Bisognerebbe chiedere all'utente cosa cerca nello specifico |
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Discussione |
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stabilire le dimensione del genoma di un lievito
Didattica
