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 Eclatante NASA: DNA all'Arsenio
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Tag   arsenico    DNA    California  Aggiungi Tag

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Autore Discussione  

0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm
Città: Paris, VIIème arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 02 dicembre 2010 : 22:22:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Eclatante scoperta dell'ente spaziale americano. In un lago tossico della California è stato identificato un batterio che una volta sottoposto a determinati trattamenti è stato in grado di...

Leggere l'articolo per il resto (sono alla ricerca di un documento più ufficiale, ossia la pubblicazione, che immagino imminente, su Science):

http://ansa.it/web/notizie/rubriche/scienza/2010/12/02/visualizza_new.html_1674383415.html

Edito con un link molto più affidabile, nei limiti umani:
http://www.sciencemag.org/content/early/2010/12/01/science.1197258

Donde
Utente Junior

biohazard



272 Messaggi

Inserito il - 02 dicembre 2010 : 22:44:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Donde  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Donde Invia a Donde un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
dal nulla arriva questo batterio e sostituisce il fosforo delle proteine e degli acidi nucleici con l'arsenico.. direi che la cosa è piuttosto incredibile!

"DNA just is. And we dance to its music."
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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Città: Paris, VIIème arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 02 dicembre 2010 : 22:47:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Esatto, ora sto cercando di accedere all'articolo con il browser del mio ateneo di modo tale da farmi qualche idea di più. Però ha dell'incredibile... Credevamo che deossiribosio + base azotata + fosfato fosse la formula della vita (ovviamente con tutte le iperboliche approssimazioni e semplificazioni), ma qui è una pagina importante delle Scienze della Vita a venire ri-scritta.
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 02 dicembre 2010 : 23:05:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Articolo molto interessante!

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Donde
Utente Junior

biohazard



272 Messaggi

Inserito il - 03 dicembre 2010 : 08:17:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Donde  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Donde Invia a Donde un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
qualcuno è riuscito a scaricarlo? io dal lab non ci riesco!

"DNA just is. And we dance to its music."
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 03 dicembre 2010 : 08:28:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Donde, te l'ho mandato via PM.

Intanto non posso che riportare questa, fresca fresca da XKCD:


According to a new paper published in the journal Science, reporters are unable to thrive in an arsenic-rich environment.

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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Città: Paris, VIIème arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 03 dicembre 2010 : 09:50:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ahahah chick
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Donde
Utente Junior

biohazard



272 Messaggi

Inserito il - 03 dicembre 2010 : 10:14:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Donde  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Donde Invia a Donde un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie! ;)

"DNA just is. And we dance to its music."
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zerhos
Utente Junior

ZERHOS

Prov.: Pisa
Città: Pisa


421 Messaggi

Inserito il - 20 dicembre 2010 : 00:26:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di zerhos  Invia a zerhos un messaggio ICQ Invia a zerhos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
interessante!!!
non posso accedere a Science, mandereste il pdf anche a me?
grazie mille!.
zerhos@hotmail.it

"l'unica differenza tra me e un pazzo è che io non sono pazzo!"
Salvador.Dalì
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Martin.diagnostica
Utente Attivo

H. pylori



1582 Messaggi

Inserito il - 20 dicembre 2010 : 01:01:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Martin.diagnostica Invia a Martin.diagnostica un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
non scordarti di mandarlo anke a me
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 20 dicembre 2010 : 01:34:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Martin, zerhos ve lo mando via messaggio privato

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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 21 dicembre 2010 : 10:00:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
vi siete persi tutto il dibattito che c'è stato su Internet e sui vari blog.

Risulta che ci sono molti dubbi sull'approccio sperimentale utilizzato nell'articolo... Non c'è nessuna prova diretta del fatto che incorporino l'arsenico al posto del fosforo nel DNA.

Alcuni blog post interessanti in italiano:
- http://mygenomix.wordpress.com/2010/12/08/cera-una-volta-science/
- http://oggiscienza.wordpress.com/2010/12/17/cosa-puo-fare-un-po%E2%80%99-di-arsenico/

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 21 dicembre 2010 : 10:19:38  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Chiaro, non fanno nessuna analisi diretta sul DNA, ma credo che abbiano comunque interessanti pointers in quella direzione. Poi come al solito queste cose sono esagerate dalla common press, ma non mi sembra che gli autori nell'articolo facciano alcun claim "serio" a riguardo.

Il punto della stabilità di un DNA-arsenico in acqua è allo stesso modo contestabile, in quanto immagino che se effettivamente hanno arsenico nel DNA abbiano anche dei sistemi per garantirne la stabilità in acqua.

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chim2
Utente Attivo

Death Note



2110 Messaggi

Inserito il - 21 dicembre 2010 : 10:58:47  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chim2 Invia a chim2 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da dallolio_gm

vi siete persi tutto il dibattito che c'è stato su Internet e sui vari blog.

Risulta che ci sono molti dubbi sull'approccio sperimentale utilizzato nell'articolo... Non c'è nessuna prova diretta del fatto che incorporino l'arsenico al posto del fosforo nel DNA.

Alcuni blog post interessanti in italiano:
- http://mygenomix.wordpress.com/2010/12/08/cera-una-volta-science/
- http://oggiscienza.wordpress.com/2010/12/17/cosa-puo-fare-un-po%E2%80%99-di-arsenico/



però non è tanto assurda neanche se fosse un'ipotesi,l'arsenico è sotto il fosforo! (più che altro bisogna anche spiegare perchè non muoiono..),cmq se nei batteri già si era trovato il selenio in amminoacidi rari e anche il selenio è sotto il carbonio,inoltre come reattività di composti in generale si avvina a quelli del C...quindi l'arsenico non dovrebbe tanto sorprendere
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domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1700 Messaggi

Inserito il - 14 luglio 2011 : 15:45:17  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La storia continua...
http://www.sciencemag.org/content/early/2011/05/26/science.1202098.full.pdf

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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M111
Utente

Pleiadi

Prov.: Lucca
Città: Guamo


838 Messaggi

Inserito il - 14 luglio 2011 : 15:49:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di M111 Invia a M111 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie per il link, me lo metto li buono e poi leggo ;)
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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Città: Paris, VIIème arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 09 luglio 2012 : 23:45:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Dopo i neutrini superluminali, un'altra smentita alle speranze di noi sognatori:

Non esiste il batterio alieno
che vive solo di arsenico
L'annuncio su Science di un microrganismo che riusciva a sopravvivere "nutrendosi" di veleno aveva fatto molto discutere. Due nuovi lavori indipendenti mostrano che non esiste: anche GFAJ-1 ha bisogno di fosforo per svilupparsi e non può sostituirlo con l'arsenico


Contrordine: l'incredibile batterio che si nutre di arsenico non esiste. L'incontro con forme di vita aliene sulla terra è quindi rimandato a data da destinarsi. A fare retromarcia, dopo la valanga di critiche seguite all'annuncio della Nasa 1, convinta di aver avvistato un microrganismo che riusciva ad incorporare nel suo Dna la sostanza tossica e a sfruttarla per la sua sopravvivenza, è Science, la stessa rivista che aveva pubblicato nel dicembre 2010 lo studio che tanto ha fatto discutere 2.

Due lavori indipendenti mostrano che anche il misterioso microrganismo, noto come GFAJ-1, ha in realtà bisogno per svilupparsi di piccole quantità di fosforo - una delle molecole chiave per la vita sulla terra a noi nota, con ossigeno, idrogeno, azoto, carbonio e zolfo - e che non è in grado di sostituirlo con l'arsenico.

Il batterio, scoperto sui fondali del Mono Lake in California, fra sedimenti ricchi di arsenico, non possiede, quindi, un inedito metabolismo basato sul veleno come ritenuto all'epoca della pubblicazione, ma rientra nella normalità, sfruttando, anch'esso il più normale e "terrestre" fosforo.

Anche il termine "alieno", con cui era stato bollato GFAJ-1, si riferiva ad un batterio "estremofilo", in grado cioè di sopravvivere in condizioni che - per gli esseri umani e la maggior parte degli organismi terrestri - sarebbero inospitali quando non fatali. Sembrava però trattarsi del primo caso in cui l'arsenico veniva adottato come componente fondamentale per lo sviluppo di un organismo, rivoluzionando potenzialmente la nostra comprensione delle condizioni essenziali per l'esistenza della vita stessa.

Dalla pubblicazione del lavoro 3della ricercatrice Felisa Wolfe-Simon, la blogosfera scientifica è entrata in fibrillazione, sollevando dubbi e critiche. Ora i due lavori usciti su Science - il primo è a firma di Tobias Erb 4, dell'Istituto di mircobiologia di Zurigo in Svizzera, il secondo condotto sotto la guida di Marshall Reaves 5, dell'ateneo di Princeton, negli Usa - confermano che il batterio ha comunque bisogno di piccole quantità di fosfato anche se può sopravvivere in un ambiente ricco di arsenico, e che la sostanza tossica da sola non è sufficiente a permetterne la vita. Inoltre, entrambi i lavori di ricerca non hanno trovato traccia del fatto che le molecole di arsenico si siano sostituite a quelle di fosforo nel Dna del batterio.

"Le nuove ricerche mostrano che GFAJ-1 non modifica i principi fondamentali della vita, contrariamente all'interpretazione dei dati dell'équipe di Felisa Wolfe-Simon", si legge in un editoriale che correda i nuovi studi su Science. L'affascinante ed estrema ipotesi, quindi, viene smentita sulle stesse pagine da cui aveva preso vita. Parte del processo scientifico, si legge ancora su Science, che per definizione si auto-corregge, quando altri ricercatori cercano di riprodurre i risultati delle ricerche pubblicate. E stavolta non ci sono riusciti



http://www.repubblica.it/scienze/2012/07/09/news/scienza_batterio_arsenico_science-38779591/?ref=HREC2-13

So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss

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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Città: Paris, VIIème arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 09 luglio 2012 : 23:51:34  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
In particolare:

GFAJ-1 Is an Arsenate-Resistant, Phosphate-Dependent Organism
ABSTRACT
The bacterial isolate GFAJ-1 has recently been proposed to substitute arsenic for phosphorus to sustain growth. We have shown that GFAJ-1 is able to grow at low phosphate concentrations (1.7 #956;M), even in the presence of high concentrations of arsenate (40 mM), but lacked the ability to grow in phosphorus-depleted (<0.3 #956;M), arsenate-containing medium. High-resolution mass spectrometry analyses revealed that phosphorylated central metabolites and phosphorylated nucleic acids predominated. A few arsenylated compounds, including C6 sugar arsenates, were detected in extracts of GFAJ-1, when GFAJ-1 was incubated with AsO43-, but further experiments showed that they formed abiotically. Inductively coupled plasma mass spectrometry confirmed the presence of phosphorus and the absence of arsenic in nucleic acid extracts. Taken together, we conclude that GFAJ-1 is an arsenate-resistant, but still a phosphate-dependent bacterium.

e

Absence of Detectable Arsenate in DNA from Arsenate-Grown GFAJ-1 Cells
ABSTRACT
A strain of Halomonas bacteria, GFAJ-1, has been claimed to be able to use arsenate as a nutrient when phosphate is limiting, and to specifically incorporate arsenic into its DNA in place of phosphorus. However, we have found that arsenate does not contribute to growth of GFAJ-1 when phosphate is limiting and that DNA purified from cells grown with limiting phosphate and abundant arsenate does not exhibit the spontaneous hydrolysis expected of arsenate ester bonds. Furthermore, mass spectrometry showed that this DNA contains only trace amounts of free arsenate and no detectable covalently bound arsenate.

So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss

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Selenocisteina
Nuovo Arrivato

lucy



64 Messaggi

Inserito il - 10 luglio 2012 : 19:14:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Selenocisteina Invia a Selenocisteina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma santo cielo, capisco che Repubblica online è gratuito e magari i giornalisti non sono poi questi gran luminari, però, anche volendo sorvolare sui mille errori di costruzione delle frasi e di virgole che sono presenti nell'articolo:
Citazione:

Dna



Citazione:

fosforo - una delle molecole chiave



Citazione:
le molecole di arsenico si siano sostituite a quelle di fosforo nel Dna del batterio.



Ma quando ci saranno dei giornalisti scientifici con un minimo di nozioni in materia?
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Geeko
Utente

Ctenophor1.0

Città: Milano


1042 Messaggi

Inserito il - 10 luglio 2012 : 19:23:25  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Geeko Invia a Geeko un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ecco un nuovo sbocco lavorativo per i biologi!


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SpemannOrganizer
Utente

Spemann

Città: Los Angeles


955 Messaggi

Inserito il - 12 luglio 2012 : 02:43:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di SpemannOrganizer Invia a SpemannOrganizer un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Selenocisteina

Ma santo cielo, capisco che Repubblica online è gratuito e magari i giornalisti non sono poi questi gran luminari, però, anche volendo sorvolare sui mille errori di costruzione delle frasi e di virgole che sono presenti nell'articolo:
Citazione:

Dna



Citazione:

fosforo - una delle molecole chiave



Citazione:
le molecole di arsenico si siano sostituite a quelle di fosforo nel Dna del batterio.



Ma quando ci saranno dei giornalisti scientifici con un minimo di nozioni in materia?




Comprendo il tuo disappunto per questi errori, che a noi sembrano madornali perchè lavoriamo in ambito scientifico. Ma al grande pubblico forse non interessa sapere che DNA si scrive tutto maiuscolo, che si parla di atomi di fosforo e non di molecole (a meno che non ti riferisca al fosforo molecolare P4). Credo invece che sia più importante che il messaggio principale arrivi diretto e chiaro, in fondo è questo quello che interessa alla maggior parte delle persone.

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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 12 luglio 2012 : 08:43:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Concordo con Spemann.

Io sono stato positivamente colpito dall'articolo di Repubblica. A parte quei piccoli errori, assolutamente perdonabili ad un giornale non scientifico (hey, ho appena "reviewato" un lavoro in cui gli autori avevano scritto ph...) hanno scritto:

1) che dire "batterio alieno" era una gran cazzata.
2) che bisogna dire "batterio estremofilo". Non avrei mai pensato di leggere "estremofilo" su Repubblica.
3) le referenze e i link agli articoli (qui ero in estasi).
4) anche se avrebbero potuto andare un pochino più a fondo della cosa, hanno spiegato come questa cosa sia assolutamente normale e segno di una scienza sana. Sinceramente mi aspettavo qualcosa del tipo "ah, guardate questi scienziati che prima ci dicono che ci sono i batteri venuti dallo spazio e poi che invece non esistono. Non sanno neanche fare il loro lavoro.". Invece hanno - probabilmente grazie all'editoriale di Science, ma va bene lo stesso - fatto notare che questo è il normale processo scientifico.

---

NOTA: la cosa che trovo triste è di essere positivamente sorpreso per cose come il punto 3 di cui sopra... Dovrebbe essere normale che un giornalista riporti le sue fonti, e non solo quando si parla di scienza, ma questa è un'altra storia.

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