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 DNA--impilamento delle basi
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SimoniNA
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Inserito il - 08 maggio 2009 : 18:49:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di SimoniNA Invia a SimoniNA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi non so se ho postato nella sezione giusta,
qualcuno sa spiegarmi brevemente sul fenomeno dell'impilamento delle basi nel DNA e perchè questo fenomeno fa in modo che in DNA a ss assorba di più L'uv rispetto a quello a ds?

Grazie mille


Ps: le basi che si impilano stanno sullo stesso filamento?

AmbienteLife
Utente Junior

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204 Messaggi

Inserito il - 08 maggio 2009 : 19:47:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AmbienteLife Invia a AmbienteLife un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao, andiamo per gradi. Le basi azotate sono strutture cicliche abbastanza insolubili in acqua, quindi di conseguenza immerse in un mezzo molto polare (come l'acqua appunto) hanno una tendenza spontanea ad avvicinarsi e ad impilarsi l'una sull'altra tenendo conto che fanno parte anche di una struttura scheletrica zucchero fosfato che impone una certa disposizione. Puoi associare l'idea alle interazioni idrofobiche delle proteine, sono localizzate nel core (centro) della proteina in modo da allontanare le catene idrofobiche degli aa dal solvente polare. Lo stesso avviene per le basi azotate, si distribuiscono una vicino all'altra affastallandosi (impilandosi). Per quanto riguarda l'assorbimento, le basi sono più libere di eccitarsi in quanto non sono più bloccate dai legami H tipici della ds, quindi assorbono più luce sempre però a 260 nm come picco di assorbimento. Questo effetto si dice EFFETTO IPERCROMICO, cioè la maggiore capacità di assorbimento da parte del DNA ss a 260 nm. Tieni conto che addirittura il DNA ds assorbe quantità di luce inferiori alla somma delle quantità assorbite dal DNA ss, questo è l'effeto IPOCROMICO. (Cioè Luce assorbita DNA ds << Luce assorbita DNA ss (1 filamento) + Luce assorbita DNA ss (2 filamento) )

Spero di esser stato chiaro, nel caso dimmi sono qui :-D

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AmbienteLife
Utente Junior

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204 Messaggi

Inserito il - 08 maggio 2009 : 19:54:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AmbienteLife Invia a AmbienteLife un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ah cmq per informazione, c'è la sezione di biologia molecolare, quindi se ti interessano informazioni su questa disciplina o anche per postare altre discussioni di queste tematiche puoi farlo li :-D

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SimoniNA
Nuovo Arrivato



11 Messaggi

Inserito il - 08 maggio 2009 : 20:06:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di SimoniNA Invia a SimoniNA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie mille sei stato chiarissimo e velocissimo


dopo aver postato mi sono resa conto che potevo postare nella sezione di biologia molecolare.

Grazie ancora
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AmbienteLife
Utente Junior

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204 Messaggi

Inserito il - 08 maggio 2009 : 22:16:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AmbienteLife Invia a AmbienteLife un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Niente figurati :-D si tranquilla, siamo a tua disposizione per altri eventuali dubbi ciao ciao

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