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Federicax1989




164 Messaggi
Inserito il - 28 novembre 2009 : 12:12:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Federicax1989 Invia a Federicax1989 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
vorrei capire a cosa e' dovuta la formazione di questo solco maggiore e minore..cioe' teoricamente lo so..e' dovuta alla relazione spaziale che si crea tra le catene;infatti i legami glicosidici non sono diametralmente opposti e ciascuna coppia di basi ha un lato piu' esteso che delimita il solco maggiore e un lato meno esteso che delimita il solco minore


ma non me lo riesco a immaginare visivamente.. anzi ho trovato anche un'immagine ma non capisco..help

dopo che mi sara' chiaro questo spero potro' capire il DNA Z e il DNA A

Soshi Fujiwara

Soshifujiwara



44 Messaggi
Inserito il - 28 novembre 2009 : 14:40:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Soshi Fujiwara Invia a Soshi Fujiwara un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io non saprei cosa risponderti, più dettagliato di così è impossibile...
Cerca di approssimare la coppia di basi ad un rombo in cui il lato maggiore è il solco maggiore e viceversa... è un pò riduttivo, ma se può aiutare...
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chick80

DNA

Città: Montpellier, France


7304 Messaggi
Inserito il - 28 novembre 2009 : 14:45:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
In effetti l'immagine da sopra non aiuta... da questa capisci meglio?


Da: http://chemistry.umeche.maine.edu/CHY431.html

Altrimenti prova a scaricarti una struttura di DNA in PDB e guardarla con RasMol (o programma equivalente), così potrai veramente girarci attorno e capire dove sono i 2 solchi
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Modificato da - chick80 in data 28 novembre 2009 14:48:40
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Federicax1989




164 Messaggi
Inserito il - 28 novembre 2009 : 17:32:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Federicax1989 Invia a Federicax1989 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ma quindi le scanalature sono dovute solo al fatto che i legami glicosidici non sono sullo stesso piano..le basi poi si adattano a spazi + piccoli e piu' grandi?

non sono riuscita a trovare nessuna immagine animata
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chick80

DNA

Città: Montpellier, France


7304 Messaggi
Inserito il - 28 novembre 2009 : 18:11:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Prova con questo PDB: http://www.pdb.org/pdb/explore.do?structureId=309D

ruotandolo in 3D è molto chiaro
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Federicax1989




164 Messaggi
Inserito il - 28 novembre 2009 : 18:57:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Federicax1989 Invia a Federicax1989 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da chick80

Prova con questo PDB: http://www.pdb.org/pdb/explore.do?structureId=309D

ruotandolo in 3D è molto chiaro


graazieee ok trovato..ogni coppia di basi da un lato confina con il solco maggiore e dall'altro col minore..vedi se ho capito bene: prendendo come riferimento a questo disegno:



guarda il secondo giro( dopo il primo giro che appare solo a meta'):
   Citosina confina col solco maggiore ;Guanina confina col minore 
   Guanina   "        "    "    "      ; Citosina "      "  "
   Timina    "        "    "    "      ; Adenina  "      "  "
  Adenina    "        "    "    "      ; Timina   "      "  "

e poi al giro seguente le cose si invertono
Citosina confina col solco minore ;Guanina confina col maggiore



INFINE: mi rispondi alla domanda del messagio precedente?grazie poi ho finito ^^
Modificato da - Federicax1989 in data 28 novembre 2009 19:40:38
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