Le differenze genetiche in H5N1

Un volatile infetto da influenza aviaria

Risulta da un’analisi filogenetica su oltre 300 campioni del virus

Un’analisi di campioni di virus H5N1 provenienti dal Sud-Est asiatico ha messo in evidenza non solo i rapporti fra i due ceppi che hanno indotto la malattia nell’uomo, ma anche il fatto che essi appartengono a due differenti sottogruppi genetici. L’analisi è stata condotta dai ricercatori dei Centers for Disease Control and Prevention (CDC) di Atlanta, che hanno presentato i loro risultati alla Conferenza internazionale sulle malattie infettive emergenti in corso in questi giorni in quella città.
"Via via che il virus continua la sua espansione geografica – ha detto Rebecca Garten dei CDC – si assiste anche a un’espansione della sua diversità genetica.

Nel 2003 c’era una sola variante genetica potenzialmente in grado di indurre una pandemia umana, ora ne abbiamo due.”
Garten e colleghi hanno condotto un’analisi filogenetica su più di 300 campioni di virus H5N1, prelevati fra il 2003 e l’estate 2005 sia da volatili sia da esseri umani. Correlando il profilo genica con le caratteristiche fisiche dei virus, ivi inclusi i siti recettoriali e le proteine di superficie, hanno determinato dove si collocava ciascun campione sull’albero filogenetico del virus.
Non tutti i virus H5N1 sono infatti geneticamente identici; oggi la maggioranza dei essi, compresi quelli che hanno provocato la malattia nell’uomo, appartengono al genotipo Z: quelli responsabili degli episodi in Viet Nam, Cambogia e Tailandia del 2003 e 2004 appartenevano tutti al clade 1, mentre il ceppo responsabile degli episodi indonesiani del 2005 appartenevano al genotipo Z, clade 2. Un numero minore di virus appartiene invece ai genotipi V e W e a quello, identificato molto di recente, chiamato G.

Fonte: (26/03/2006)
Pubblicato in Genetica, Biologia Molecolare e Microbiologia
Tag: H5N1

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