I primi microscopi efficaci vennero prodotti in Olanda alla fine del XVI secolo. Galileo stesso ne inviò uno di sua costruzione al principe Federico Cesi, fondatore dell'Accademia dei Lincei per mostrargliene il funzionamento.
Ma il padre del microscopio moderno è sicuramente l'olandese Antony Van Leeuwenhoek e che grazie a questo strumento confutò la teoria della generazione spontanea in voga allora.
Van Leeuwenhoek scoprì numerosi soggetti microscopici come protozoi e spermazoi e pose le basi della biologia cellulare e della microbiologia.
Siamo riusciti a recuperare alcuni protozi conservati all'Istituto Pasteur di Parigi, si dice che provengano dai campioni analizzati dello stesso Van Leeuwenhoek.
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