Rasmol in italiano

RasMol_2.7.2.1 e' un programma per la visualizzazione di molecole in 3D,
progettato per la visualizzazione di proteine, acidi nucleici e piccole
molecole, basato su RasMol-2.6. di Roger Sayles. Il programma ha come
finalita'la visulizzazione di immagini di qualita' per scopi didattici e
di divulgazione.

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Altre risorse di bioinformatica

RasMol e' compatibile con i seguenti sistemi operativi: Microsoft
Windows, Apple Macintosh, UNIX e VMS. Le versioni UNIX e VMS richiedono
un display X Windows a 8, 24 o 32 colori(X11R4 o successivo). Il
programma legge file di coordinate molecolari e mostra interattivamente
la molecola su schermo in una serie di schemi di colori e di
rappresentazioni molecolari.

Le rappresentazioni attualmente disponibili includono i fili di ferro
depth-cued, cilindri ' Dreiding ', sfere da riempire (CPK), sfere e
clindri, solidi e nastri biomolecolari, le etichette dell'atomo e le
superfici punteggiate.

Si puo' accedere alla sezione RasMol help digitando "help

" o
"help " dalla command line. Per accedere alla lista
completa dei comandi di RasMol basta digitare "help commands", oppure,
in modo abbreviato "help". Si prega dileggere con attenzione le note
riportate nella sezione "help notices".

RasMol Copyright (C) Roger Sayle 1992-1999
Versione 2.6x1 Modifiche Copyright (C) Arne Mueller 1998
Versionse 2.5-ucb and 2.6-ucb Modifiche Copyright (C)
UC Regents/ModularCHEM Consortium 1995, 1996
RasTop 1.3 Copyright (C) Philippe Valadon 2000
Versione 2.7.0, 2.7.1, 2.7.1.1, 2.7.2, 2.7.2.1 Modifiche
Copyright (C) Herbert J. Bernstein 1998-2001
rasmol@bernstein-plus-sons.com

?notice
?notices

Questo software e' stato creato da diverse fonti. La maggior parte del
codice deriva dalla versione 2.6 di RasMol 2.6, come ideata da Roger
Sayle. Vedi:
ftp://ftp.dcs.ed.ac.uk/pub/rasmol

Il codice di torsione dell'angolo, il nuovo codice POVRAY3 ed altre
caratteristiche derivano dalle revisioni 2.6x1 di RasMol curate da Arne
Mueller. Vedi:
ftp://nexus.roko.goe.net/pub/rasmol

Il codice Ramachandran per printer plot deriva da fisipl creato da
Frances C. Bernstein. Vedi il programma su nastro della Banca Dati
delle Proteine.

Le modifiche CIF fanno uso di un archivio basato in parte sull'archivio
CBFlib di Paul J. Ellis e Herbert J. Bernstein. Vedi:
http://www.bernstein-plus-sons.com/software/CBF

Parti della CBFlib sono liberamente basate sul pacchetto software
CIFPARSE della NDB presso la Rutgers University. Vedi:
http://ndbserver.rutgers.edu/NDB/mmcif/software

Per avere informazioni sulle note delle applicazioni digitare i comandi
RasMol 'help copying', 'help general', 'help IUCR', 'help CBFlib', e
'help CIFPARSE'. Digitare invece 'help copyright' per ottenere
informazioni sulle licenze. Per la versione RasMol V2.6 o per le
versioni le precedenti, digitare il comando 'help oldnotice'.

?copyright
Copyright
RasMol 2.7.2.1
Programma per la visualizzazione di Molecole in 3D
2 Aprile 2001

Basato su RasMol 2.6 di
Roger Sayle
Biomolecular Structures Group,Glaxo Wellcome Research & Development
Stevenage, Hertfordshire, UK
Versione 2.6, Agosto 1995, Versione 2.6.4, Dicembre 1998
Copyright (C) Roger Sayle 1992-1999

e Basato sulle modifiche a cura di

Autore Versione, Data Copyright

Arne Mueller RasMol 2.6x1 Maggio 98 (C) Arne Mueller 1998

Gary Grossman and RasMol 2.5-ucb Novembre 95 (C) UC Regents/ModularCHEM
Marco Molinaro RasMol 2.5-ucb Novenbre 96 Consortium 1995, 1996

Philippe Valadon RasTop 1.3 Augosto 00 (C) Philippe Valadon 2000

Herbert J. RasMol 2.7.0 Marzo 99 (C) Herbert J. Bernstein
Bernstein RasMol 2.7.1 Giugno 99 1998-2001
RasMol 2.7.1.1 Gennaio 01
RasMol 2.7.2 Augosto 00
RasMol 2.7.2.1 Aprile 01

e con le traduzioni di

Autore articolo lingua

Isabel Serván Martínez,
José Miguel Fernández Fernández 2.6 Manuale spagnola
José Miguel Fernández Fernández 2.7.1 Manuale spagnola
Fernando Gabriel Ranea 2.7.1 menu e messaggi spagnola

Jean-Pierre Demailly 2.7.1 menu e messaggi francese

Giuseppe Martini, Giovanni Paolella, 2.7.1 menu e messaggi italiana
A. Davassi, M. Masullo, C. Liotto 2.7.1 archivio di aiut

Questa edizione da
Herbert J. Bernstein, Bernstein + Sons, P.O. Box 177, Bellport, NY, USA
yaya@bernstein-plus-sons.com
Copyright (C) Herbert J. Bernstein 1998-2001
?copying rasmol
Copying RasMol

Questa versione si basa su RasMol 2.6_CIF.2, RasMol 2.6x1 e RasMol 2.6.4. Non e'
consentito apportare modifiche a RasMol, ma e' consentita e auspicata la copia e
la distribuzione gratuita solo alle seguenti condizioni:

1. Se si include la completa documentazione, specialmente il documento NOTICE,
in quello che si intende distribuire, o se si forniscono chiare indicazioni su
dove e' possibile ottenere una copia della documentazione; e

2. se si forniscono, dove necessario, i dovuti riferimenti citando in maniera
appropriata la versione e gli autori; e

3. se non si lascia in alcun modo intendere che gli autori originali vogliano
fornire una garanzia di alcun tipo.

Se si desidera utilizzare parti di RasMol in qualche altro programma, e'
possibile apportare le conseguenti modifiche di RasMol facendo cio' che
legalmente si definisce "lavoro derivato" Tutto questo non soltanto e'
consentito, ma viene anche incoraggiato dagli autori nell'osservanza delle
seguenti procedure:

4. Fornire una documentazione esaustiva di cosa deferisce dalla versione
originale di RasMol e come; e

5. Rendere disponibile la fonte del codice modificato.

La presente versione di RasMol non e' di pubblico dominio, tuttavia viene
concessa liberamente alla comunita' con l'obiettivo di dare un contributo al
progresso della scienza. Le eventuali modifiche, pertanto, devono essere
apportate in tale ottica, consentendoci poi di poterle includere nelle future
versioni di RasMol.

?general
?generalnotice
?general notice
General Notice

Le seguenti note si riferiscono al presente lavoro nella sua interezza ed ai
lavori che esso include:

* Le attivita' creative dipendono dal continuo e vivace scambio di idee. Ci sono
leggi e regole che stabiliscono diritti e responsabilita' sia per gli autori
sia per i fruitori. Con questo avviso non si intende scoraggiare l'uso del
software e dei documenti in esso contenuti, ma evitare ogni possibile
fraintendimento su termini e condizioni di uso.

* Si prega di legere attentamente la seguente nota. Se non dovesse essere
comprensibile, anche se solo in parte, si consiglia di ricorrere alla consulenza
di un legale prima di utilizzare il software ed i documenti in esso contenuti.
Oltre al rispetto dei diritti di copyright, siete pregati di indicare
chiaramente i riferimenti dove e' necessario, citando il pacchetto, gli autori
e la URL o le altre fonti do cui deriva, o fornendo i riferimenti primari
equivalenti in letteratura con gli stessi autori.

* Alcuni dei software e dei documenti inclusi all'interno di questo pacchetto
sono proprieta' intellettuale di diverse parti, tuttavia cio' non implica che
tali diritti siano in qualche modo diminuiti o alienati.

* Per i software o documenti sottoposti a Copyright, TUTTI I DIRITTI SONO
RISERVATI AI PROPRIETARI DI TALE COPYRIGHT.

* Gli autori dei vari documenti e software qui inclusi si sono sforzati di
assicurare che la documentazione rispecchi il funzionamento di questi, tuttavia,
nel caso in cui si dovessero riscontrare eventuali problemi, la vostra
segnalazione ci e' particolarmente gradita. I programmi, i documenti ed ogni
file creato dai programmi sono stati forniti **COME SONO** senza alcuna
garanzia di correttezza, commerciabilita' o conformita' per uso generale o
particolare.

* OGNI RESPONSABILITA', PER QUALSIASI CONSEGUENZA AVVERSA DERIVANTE DALL'USO
DEI PROGRAMMI O DEI DOCUMENTI O DI QUALSIASI FILE O FILE CREATI DALL'USO DEI
PROGRAMMI O DEI DOCUMENTI E' ESCLUSIVAMENTE A CARICO DEI FRUITORI DEI PROGRAMMI
O DEI DOCUMENTI O DEI FILE E NON A CARICO DEI RISPETTIVI AUTORI DI QUESTI.

La copia e la distribuzione del presente pacchetto, se non si apportano
modifiche o prodotti derivati, e' subordinata all'accettazione delle condizioni
summenzionate, e al rispetto dei termini e delle condizioni sottoelencati:

1. Se si include la completa documentazione, specialmente il documento NOTICE,
in cio' che si intende distribuire, o se si forniscono chiare indicazioni su
dove e' possibile ottenere una copia della documentazione; e

2. Se si forniscono, dove necessario, i dovuti riferimenti citando in maniera
appropriate la versione e gli autori; e

3. Se non si lasca in alcun modo intendere che gli autori originali vogliano
fornire una garanzia di alcun tipo.

Inoltre, e' possibile modificare il presente pacchetto e creare prodotti
derivati alle seguenti condizioni:

4. Se si fornisce una documentazione esaustiva di cosa deferisce dalla
versione originale di RasMol e come; e

5.Se si rende disponibile la fonte del codice modificato.

?old
?oldnotice
?rasmol v2.6 notice
RasMol V2.6 Notice
La seguente nota si riferisce alla versione diRasMol V 2.6 ed a quelle
precedenti.

Le informazioni contenute nel presente documento sono soggette a modifiche
senza preavviso e cio' non comporta alcun obbligo da parte del fornitore. Il
presente pacchetto viene venduto/distribuito a condizione che, non sia
noleggiato, rivenduto o dato in prestito, mediante azioni commerciali o altra
forma, o altrimenti fatto circolare senza il consenso del fornitore, in
nessun'altra forma di pacchetto o copertina diversa da quella originaria.

Non e' consentito riprodurre parti del presente manuale o del software di
accompagnamento, conservato su sistemi di ricerca sia di tipo ottico sia di
tipo magnetico, nastro o altro supporto, o trasmesso in qualsiasi forma o modo,
elettronico, meccanico, fotocopie, o altro se non per uso strettamente
personale.

Il presente prodotto non puo' essere usato nella progettazione, manutenzione,
costruzione, operativita' o uso di impianti nucleari, ne' per il volo, in
navigazione o come attrezzatura di supporto da terra per la per comunicazione
fra aerei. l'autore non sara' responsabile, integralmente o in parte, per le
rivendicazioni o per i danni derivanti da tali usi, incluso morte, bancarotta
o guerra.

?iucrpolicy
?iucr policy
?iucr policy
IUCR Policy
La politica diIUCr per la Protezione e la Promozione del File STAR e degli
Standard CIF per l' Exchanging and Archiving Electronic Data

Premessa

Il File di Informazione Cristallografica (CIF)[1] e' uno standard per lo
scambio di informazioni promulgate dalla International Union of
Crystallography (IUCr). CIF (Hall, Allen & Brown, 1991) e' il metodo
raccomandato per sottomettere pubblicazioni alla Acta Crystallographica
Section C, e report di determinazioni cristallografiche ad altre sezioni
dell'Acta Crystallographica ed a molte altre riviste. La sintassi di un CIF
e' un sottoinsieme del formato piu' generale STAR File[2]. Il CIF ed il File
STAR sono gli standard sempre piu' usati nelle scienze strutturali per lo
scambio di dati e per l'archiviazione, e possiamo ritenere di aver dato un
contributo significativo su questi argomenti in altri campi.

Dichiarazione di intento

L'interesse della IUCr nel File STAR e' uno standard per lo scambio
universale di dati per la scienza, e il suo interesse nel CIF, un
formato derivato del File STAR, e' uno standard per l'archiviazione e lo
scambio di dati della cristallografia e della scienza strutturale.

Protezione degli standard

Per proteggere il File STAR e i CIF come standard per lo scambio e
l'archiviazione di dati elettronici, la IUCr, per conto della comunita'
scientifica,

* detiene i diritti di autore (copyrights) sugli standard stessi,

* possiede i trademarks ssociati ed i marchi di servizi, e

* detiene un brevetto sul File STAR.

Questi diritti sulla proprieta' intellettuale si riferiscono solamente ai
formati di interscambio, e non ai dati contenuti in essi o nel software
usato per la creazione, accesso o manipolazione di dati.

Promozione degli standard

La IUCr, in veste di garante, impone in caso di vendita o distribuzione
di software che supportano File STAR o dati CIF, il rispetto delle
seguenti condizioni:

* I Software che dichiarano di leggere file scritti per gli standard
di File STAR o CIF devono essere in grado di estrapolare i dati
pertinenti da un file che sia in conformita' con la sintassi dei
rispettivi File STAR o CIF.

* I Software che dichiarano di scrivere file per gli standard di File
STAR o CIF, devono produrre file che siano in conformita' con la sintassi
dei rispettivi File STAR, o CIF.

* I Software che dichiarano di leggere le definizioni tratte da un
dizionario di dati specifici approvato dalla IUCr devono essere in grado
di estrarre ogni definizione pertinente in conformita' con la lingua di
definizione del dizionario (DDL)[3] ad esso associata.

La IUCr, attraverso il suo Comitato sugli standard CIF, dara' assistenza
a chiunque sviluppi software al fine di rendere possibile il rispetto
delle summenzionate condizioni.

Glossario

[1] CIF: e' un file di dati che e' in conformita' con la sintassi di file
definita alla http://www.iucr.org/iucr-top/cif/spec/index.html

[2] STAR File: e' un file di dati che e' in conformita' con la sintassi
di file definita alla http://www.iucr.org/iucr-top/cif/spec/star/index.html

[3] DDL: e' la lingua usata in un dizionario di dati per definire to voci
di dati in terminidi "attributi". I dizionari ad oggi approvati dalla
IUCr, e le versioni DDL usate per la creazione dei dizionari stessi, sono
elencate alla http://www.iucr.org/iucr-top/cif/spec/ddl/index.html

Ultima modifica: 30 September 2000

La politica della IUCR sui Copyright (C) 2000 International Union of
Crystallography

?cbflib
CBFLIB
La seguente nota di reclamo si riferisce alla versione CBFlib V0.1,
da cui deriva in parte il presente codice.

* I materiali qui forniti sono stati sviluppati grazie al patrocinio
del Governo degli Stati Uniti. Ne' gli Stati Uniti, ne' il U.S. D.O.E., ne'
l'Universita' Leland Stanford Junior, ne' i suoi impiegati, offrono alcuna
garanzia, implicita o esplicita, o si assumono alcuna responsabilita'
legale o di qualunque altro tipo riguardo alla accuratezza, esaustivita'
o utilita' di ogni informazione, apparato, prodotto o processo, ne'
dichiara che il suo uso non potra' infrangere i diritti pivatamente
acquisiti. Il riferimento a qualsiasi prodotto, al suo produttore
o fornitore non implica, ne' intende implicare approvazione o
disapprovazione o efficacia d'uso. Gli Stati Uniti e l'Universita'
manterranno sempre il diritto di usare e diffondere i prodotti per
qualunque scopo.

Notia 91 02 01

?cifparse
CIFPARSE
Parti di questo software sono liberamente basate sul pacchetto
software CIFPARSE dalla NDB della Rutgers University. Vedi:

http://ndbserver.rutgers.edu/NDB/mmcif/software

CIFPARSE e' parte dell'applicazione NDBQUERY, un componente del programma
per il Nucleic Acid Database Project [ H. M. Berman, W. K. Olson,
D. L. Beveridge, J. K. Westbrook, A. Gelbin, T. Demeny, S. H. Shieh,
A. R. Srinivasan, e B. Schneider. (1992). Nucleic Acid Database:
A Comprehensive Relational Database of Three-Dimensional Structures of
Nucleic Acids Biophys J., 63, 751-759.], la cui cooperazione e' fortemente
riconosciuta, specialmente nella forma dei concetti di design creati da
J. Westbrook.

Si prega di assicurarsi che la seguente nota sia presente in CIFPARSE
API:

Questo programma viene fornito SENZA GARANZIA DI COMMERCIABILITA' O DI
ADEGUATEZZA PER SCOPI PARTICOLARI E SENZA ALCUN'ALTRA GARANZIA, ESPRESSA
O IMPLICITA. LA RUTGERS NON AFFERMA O GARANTISCE CHE IL SOFTWARE NON
POSSA INFRANGERE I DIRITTI DI AUTORE O ALTRI DIRITTI DI PROPRIETA.

RasMol e' un programma di grafica molecolare che permette la
visualizzazione di proteine, acidi nucleici e piccole molecole. Questo
programma e' stato ideato per rendere possibile la visualizzazione, e la
produzione di immagini a scopo didattico e di divulgazione. RasMol e'
compatibile con i seguenti sistemi operativi e architetture: Microsoft
Windows, Apple Macintosh, sistemi UNIX e VMS. Le versioni UNIX e VMS
richiedono un display X Windows a 8, 24 o 32 colori (X11R4 o successivo).
La versione X Windows di RasMol fornisce supporto opzionale per finestra
di dialogo in hardware e comunicazione mediante memoria condivisa e
accellerata. (via XInput e le estensioni di MIT- SHM) se queste sono
disponibili nell' X Server
in uso.

Il programma legge file di coordinate molecolari e mostra interattivamente
la molecola su schermo in una serie di schemi di colori e di
rappresentazioni molecolari. I file di entrata includono, specificamente,
i formati Brookhaven Protein Databank (PDB), Tripos Associates' Alchemy
y Sybyl Mol2, Molecular Design Limited's (MDL) Mol, Minnesota
Supercomputer Centre's (MSC) XYZ (XMol), CHARMm, formato CIF e archivi
mmCIF. Se non e' contenuta in archivio l'informazione sul collegamento,
RasMol la calcolera' automaticamente. Le rappresentazioni attualmente
disponibili includono i fili di ferro depth-cued, cilindri ' Dreiding ',
sfere da riempire (CPK), sfere e clindri, solidi e nastri biomolecolari,
le etichette dell'atomo e le superfici punteggiate.

Fino a 5 molecole possono essere caricate e visualizzate immediatamente.
Qualsiasi o tutte le molecole puo' essere ruotata e spostata.

Si puo' accedere alla sezione di RasMol help digitando "help " o
"help " dalla command line. Per accedere alla lista
completa dei comandi di RasMol occorre digitare "help commands", oppure
semplicemente "help", in modo abbreviato. Si prega di leggere le note
riportate nella sezione "help notices".

RasMol Copyright (C) Roger Sayle 1992-1999
Version 2.6x1 Mods Copyright (C) Arne Mueller 1998
Version 2.5-ucb, 2.6-ucb Mods
Copyright (C) UC Regents/ModularCHEM Consortium 1995, 1996
RasTop 1.3 Copyright (C) Philippe Valadon 2000
Version 2.7.0. 2.7.1, 2.7.1.1, 2.7.2, 2.7.2.1 Mods
Copyright (C) Herbert J. Bernstein 1998-2001
(yaya@bernstein-plus-sons.com)

?commands
?keywords

Il programma permette l'esecuzione dei comandi interattivi digitati al
prompt di RasMol nella finestra in uso. Ogni comando va dato su un
singolo rigo e deve terminare o con un trattino o con un invio. Le
parole-chiave si possono digitare indifferentemente con caratteri in
maiuscolo o in minuscolo. Tutti gli spazi bianchi sono ignorati, eccetto
quelli che separano la parola-chiave dagli argomenti di un comando.

Di seguito sono riportati i comandi/parole-chiave attualmente
riconosciuti dal programma. Per ulteriori informazioni sulle singole
funzioni di RasMol e' necessario digitare "help ".

backbone background bond cartoon centre
clipboard colour connect cpk define
depth dots echo english exit
french hbonds help italian label
load molecule monitor pause print
quit refresh renumber reset restrict
ribbons rotate save script select
set show slab source spacefill
spanish ssbonds star stereo strands
structure trace translate unbond wireframe
write zap zoom

?backbone
Backbone
Syntax: backbone {}
backbone
backbone dash

Il comando 'backbone' permette la rappresentazione della sequenza di
un polipeptide come una serie di legami che connettono i carboni alfa
adiacenti di ciascun aminoacido in una catena. La visualizzazione di
questi legami viene attivata e disattivata con il parametro del comando
allo stesso modo del comando fili di ferro ( 'wireframe'). Il comando
'backbone off' disattiva la visualizzazione del legame selezionato , e
con 'backbone on' o un numero, invece, si attiva. Il numero puo' essere
utilizzato per specificare il raggio del cilindro della rappresentazione
sia in Angstrom sia in unita' RasMol . Un valore di parametro di 500
(2.0 Angstroms) o maggiore invia un messaggio di errore: "Parameter
value too large" (valore di parametro troppo alto: errore).
Per colorare gli elementi dello scheletro (Backbone) si utilizza
il comando di RasMol 'colour backbone'.

Backbone si usa anche come uno dei gruppi predefiniti ("help sets") e
come parametro per i comandi 'set hbond' e 'set ssbond'. Il comando di
RasMol 'trace' produce uno scheletro dalla superfice liscia, in
contrasto con 'backbone' che collega carboni con linee rette.

La struttura 'backboneo/oo rappresentata sotto forma di trattini si puo'
visualizzare con il comando 'backbone dash'.

?background
Background
Syntax: background

The RasMol 'background' command is used to set the colour of the
"canvas" background. The colour may be given as either a colour name
or a comma separated triple of Red, Green and Blue (RGB) components
enclosed in square brackets. Typing the command 'help colours' will
give a list of the predefined colour names recognised by RasMol. When
running under X Windows, RasMol also recognises colours in the X
server's colour name database.

The 'background' command is synonymous with the RasMol 'set background'
command.

?bond
Bond
Syntax: bond +
bond pick
bond rotate {}

Il comando di RasMol 'bond +' aggiunge il legame indicato
all' illustrazione, aumentante l' ordine schiavo se il legame gia' esiste.
Il comando 'bond pick' seleziona i due atomi specificato
dai numeri di serie dell' atomo come le due estremita' d'un legame
intorno a cui il comando 'rotate bond ' sara' applicato. Se nessun
legame esiste, e' creato.

La rotazione intorno ad un legame precedentemente selezionato puo' essere
specificata dal comando 'rotate bond ', o puo' anche essere gestita
con il mouse, usando il comando 'bond rotate on/off' o icomandi equivalenti
'rotate bond on/off'.

?cartoon
Cartoon
Syntax: cartoon {}

Il comando di RasMol 'cartoon'(vignetta) visualizza una molecola in
'ribbons' (nastri) secondo il modello (MolScript) di Richardson
'cartoons', rappresentato come nastri spessi. Il modo piu'semplice per
ottenere la vignetta (cartoon) di una proteina e' quello di usare
l'opzione 'Cartoons' dal menu' 'Display'. Il comando 'cartoon'
rappresenta i residui al momento selezionati sotto forma di nastro
spesso con una ampiezza specificata dall'argomento del comando. Se si
usa il comando senza dare un parametro, l'ampiezza del nastro viene
determinata dalla struttura secondaria della proteina, come descritta
nel comando 'ribbons'. Per default, i terminali C della catena beta
vengono visualizzati come teste di frecce. Per attivarli o disattivarli
si usa il comando 'set cartoons'. Per regolare la profondita' si usa
invece il comando 'set cartoons '. Il comando 'set cartoons'
usato senza parametri riporta queste due opzioni per default al loro
valore iniziale.

?center
?centre
Centre
Syntax: centre {} {translate|center}
center {} {translate|center}

Il comando di RasMol 'centre' definisce il punto attorno al quale con
il comando 'rotate' e le barre di spaziamento si fa ruotare la molecola
in oggetto. Senza un parametro il comando centre ripistina il centro di
rotazione al centro di gravita' della molecola. Se si specifica una
espressione di atomo, RasMol fa ruotare la molecola attorno al centro
di gravita' del gruppo di atomi specificati dall'espressione. Quindi, se
l'espressione specifica un singolo atomo, quest'ultimo restera'
'immobile' durante la rotazione.

Per maggiori informazioni sulle espressioni in RasMol si rimanda su
'help expression'.

In alternativa, per ottenere un centro di rotazione e' possibile
indicare i tre valori separati dalla virgola ed in parentesi quadra
[CenX, CenY, CenZ] in unita' RasMol (1/250 di Angstrom) dal centro
di gravita'.

Le forme facoltative 'centre ... translate'' e 'centre ... center puo'
essere usato per specificare l' uso d'un centro spostato di rotazione
(non necessariamente nel centro della tela di canapa) o un centro di
rotazione che e'disposta al centro della tela di canapa. Cominciando
da RasMol 2.7.2, il difetto deve concentrarsi il nuovo asse sulla tela
di canapa.

?clipboard
Clipboard
Syntax: clipboard

Il comando di RasMol 'clipboard' invia una copia dell'immagine in uso sul
'clipboard' della grafica locale. Il comando, tuttavia, non si puo' ancora
utilizzare su UNIX o macchine VMS. E' stato ideato per semplificare il
trasferimento di immagini tra applicazioni in Windows o Apple Macintosh.

Se si usa RasMol su sistemi UNIX o VMS e' possibile ottenere questa funzione
generando una immagine raster in un formato che il ricettore del programma
puo' leggere con il comando di RasMol 'write'.

?color
?colour
Colour
Syntax: colour {