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 Biologia Molecolare
 Il primer del filamento LEADER dopo la replicazione del DNA
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Mendel
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31 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2015 : 20:24:19  Mostra Profilo Invia a Mendel un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Dopo la replicazione del DNA, il primer d'innesco a RNA sul filamento LEADER, viene conservato o sostituito con DNA? E se si, come?

I libri di Biologia Molecolare sembrano preoccuparsi solo dei frammenti di Okazaki sul filamento lagging e pongono il problema della sostituzione dei numerosi primer ad RNA che la replicazione di questo filamento richiede.

Ma nessuno spiega come avviene invece la sostituzione del primer ad RNA all'inizio del filamento LEADER. Anche su questo agisce la telomerasi oppure il meccanismo è diverso? Agisce una RNAsi? E se è cosi come si fa dopo ad aggiungere DNA se l'innesco è perso?

ErgoCalciferolo
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stirrer



70 Messaggi

Inserito il - 04 settembre 2015 : 19:08:37  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ErgoCalciferolo Invia a ErgoCalciferolo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Mendel

Dopo la replicazione del DNA, il primer d'innesco a RNA sul filamento LEADER, viene conservato o sostituito con DNA? E se si, come?

I libri di Biologia Molecolare sembrano preoccuparsi solo dei frammenti di Okazaki sul filamento lagging e pongono il problema della sostituzione dei numerosi primer ad RNA che la replicazione di questo filamento richiede.

Ma nessuno spiega come avviene invece la sostituzione del primer ad RNA all'inizio del filamento LEADER. Anche su questo agisce la telomerasi oppure il meccanismo è diverso? Agisce una RNAsi? E se è cosi come si fa dopo ad aggiungere DNA se l'innesco è perso?


Che c'entra la telomerasi? In quale posizione del genoma viene sintetizzato il primer?

Il primer del filamento guida viene sostituito con DNA.
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Mendel
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31 Messaggi

Inserito il - 15 settembre 2015 : 20:25:07  Mostra Profilo Invia a Mendel un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La telomerasi è un'enzima che aggiunge sequenze di DNA all'estremità 3'nelle regioni dei telomeri, evitando cosi che esse si accorcino dopo ogni ciclo di replicazioni. Tuttavia questo enzima si trova solo nelle cellule germinali e staminali, non in quelle somatiche dove il problema dei frammenti di okazaki all'estremità dei telomeri comporta inevitabilmente l'accorciamento degli stessi.

E questo è un problema, ma lo stesso problema non si dovrebbe verificare anche per il primer sintetizzato all'inizio del filamento leader? Come fa questo primer ad essere sostituito con DNA se la DNA polimerasi non funziona senza un innesco a RNA?
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Mendel
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31 Messaggi

Inserito il - 16 settembre 2015 : 11:32:50  Mostra Profilo Invia a Mendel un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La telomerasi è un'enzima che aggiunge sequenze di DNA all'estremità 3'nelle regioni dei telomeri, evitando cosi che esse si accorcino dopo ogni ciclo di replicazioni. Tuttavia questo enzima si trova solo nelle cellule germinali e staminali, non in quelle somatiche dove il problema dei frammenti di okazaki all'estremità dei telomeri comporta inevitabilmente l'accorciamento degli stessi.

E questo è un problema, ma lo stesso problema non si dovrebbe verificare anche per il primer sintetizzato all'inizio del filamento leader? Come fa questo primer ad essere sostituito con DNA se la DNA polimerasi non funziona senza un innesco a RNA?
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ErgoCalciferolo
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stirrer



70 Messaggi

Inserito il - 17 settembre 2015 : 20:24:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ErgoCalciferolo Invia a ErgoCalciferolo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Mendel
E questo è un problema, ma lo stesso problema non si dovrebbe verificare anche per il primer sintetizzato all'inizio del filamento leader? Come fa questo primer ad essere sostituito con DNA se la DNA polimerasi non funziona senza un innesco a RNA?


Domanda: In quale posizione del filamento guida viene sintetizzato il primer? Perché dici "inizio"?

Facciamo un esempio concreto. Sappiamo che la replicazione nel lievito S. cerevisiae avviene in siti chiamati "ARS". Dove si localizzano questi "ARS"? Inizio? Inizio di che? Sei sicuro che si trovano all'inizio?

P.S.: Meno male che il tuo problema non si presenta in un cromosoma circolare come quello del E. coli.
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