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neobule2
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3 Messaggi

Inserito il - 03 febbraio 2009 : 19:09:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di neobule2 Invia a neobule2 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
non riesco a trovare il primer rev sulla sequenza.
devo fare il complementare revertato della sequenza che sta sull'eppendorf?sto lavorando con primers ordinati da altri e non ci capisco niente!
help me
Neo

GFPina
Moderatore

GFPina

Cittā: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 03 febbraio 2009 : 22:48:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Beh a parte che esistono dei programmi apposta per cercare i primers sulle sequenze, come ad es. AnnHyb che indicavo qui: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=10600&SearchTerms=annhyb

comunque il primer reverse si lega alla tua sequenza, quindi sarā inverso e complementare alla sequenza, ad es.
seq:   5' --------TGACTAAATTTGAGCTCCTGA---- 3'
primer:        3' ACTGATTTAAACTCGAGGACT  5'

quindi la sequenza del primer sulla provetta sarā: 5' TCAGGAGCTCAAATTTAGTCA 3'

In ogni caso esistono anche tool per fare il reverse, complement o reverse-complement delle sequenze, ad es. http://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html

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