Forum

Nome Utente:
Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 Laboratorio
 Bioinformatica e Biostatistica
 allineamento primers-genoma
 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

markino3
Nuovo Arrivato



26 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2010 : 13:57:25  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di markino3 Invia a markino3 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti!
Avrei bisogno di un piccolo aiuto: ho disegnato dei primers per il 16S di un Lattobacillus casei e vorrei allinearli con l'intero genoma per vedere se vi sono altri match che potrebbero portare all'amplificazione di regioni indesiderate. Come posso fare? se utilizzo il programma Blast non mi permette di allineare sequenze così corte come quelle dei primers con l'intero genoma, potete aiutarmi?
Grazie mille
Marco

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2010 : 14:02:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si può settare Blast con opportuni parametri (c'è spiegato nell'help)

Oppure puoi usare Primer Blast che è fatto apposta!
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina