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pepy86
Nuovo Arrivato

16 Messaggi

Inserito il - 11 novembre 2008 : 19:29:20

salve a tutti....nel corso di genomica strutturale e funzionale, mi è stata spiegata la pcr real time e la relativa quantificazione dell'espressione genica in modo sia relativo che assoluto.
per quanto riguarda quest'ultima cosa, ho capito il meccanismo e anche il procedimento matematico che c'è dietro ma non riesco a dare una definziione di valore soglia e di ct...qualcuno mi può aiutare?grazie...ho provato da sola ma non sono soddisfatta..(esame giovedì)

marok
Utente Junior

150 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 08:58:38

Il valore soglia è un valore arbitrario al quale decidi di analizzare la reazione.
Il ct e il ciclo al quale la fluorescenza raggiunge il valore soglia.
Se ti può essere utile a pag 4 trovi praticamente la definizione:
http://www.genedia.it/italiano/quaderno/Opuscoli%20da%20pubb/RealTimeOPFO_tec1.pdf
Ma come hai fatto a capire il meccanismo della real se non hai capito queste cose basilari

chick80
Moderatore

Città: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 10:50:48

Citazione:
Il valore soglia è un valore arbitrario al quale decidi di analizzare la reazione.

Aggiungerei: corrispondente all'inizio della fase esponenziale di amplificazione

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marok
Utente Junior

150 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 13:24:44

Se è all'inizio o alla fine non cambia nulla basta che sia fase esponenziale e comunque anche in base a come escono le curve non sempre la fase esponenziale è la migliore. Certo in un esame se te lo chiedono "fase esponenziale" è l'unica risposta giusta, ma poi in campo non sempre è così.

chick80
Moderatore

Città: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 18:15:07

Citazione:
non sempre la fase esponenziale è la migliore

Se prendi il Ct fuori dalla fase esponenziale non puoi fare alcuna considerazione quantitativa

Comunque sia, per un esame "l'inizio della fase esponenziale" è una definizione appropriata.