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matsche
Nuovo Arrivato

Zio Albert
Prov.: PV/CA
Città: Pavia/Cagliari


23 Messaggi

Inserito il - 02 gennaio 2009 : 11:34:58  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di matsche  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di matsche Invia a matsche un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti volevo fare la blast di una sequenza inventata per cui non c'è il protein ID come posso fare?

"Sapere aude! Habe Mut, dich deines eigenen Verstandes zu bedienen!
Sapere aude! Abbi il coraggio di servirti della tua propria intelligenza!" Immanuel Kant
...Après moi, le déluge...

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 02 gennaio 2009 : 12:31:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Beh, non ti serve il protein id per fare un blast. Puoi mettere direttamente la sequenza inventata in formato FASTA

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Schuldiner86
Utente Junior

Biotech

Prov.: Viterbo
Città: Bologna


581 Messaggi

Inserito il - 02 gennaio 2009 : 14:50:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Schuldiner86  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Schuldiner86  Invia a Schuldiner86 un messaggio Yahoo! Invia a Schuldiner86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Se la vuoi in formato FASTA basta che scrivi

>Quello che ti pare, tanto non conta
WTRGA ecc..

Quello che scrivi dopo > non ha nessuna ripercussione sul BLAST, quindi puoi inventare qualsiasi sequenza senza avere un protein ID, al momento della ricerca incollerai tutta la sequenza...



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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 02 gennaio 2009 : 17:27:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Anzi, a dire la verità puoi anche omettere la prima riga (quella che inizia con >) e funziona lo stesso!

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