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ercole
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Inserito il - 26 gennaio 2009 : 17:20:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ercole Invia a ercole un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve raga

sono stati determinati i seguenti genotipi del locus B in una popolazione formata da 10000individui. sono stati risultati i seguenti valori BB 99 bb 1799 bb 8002 calcolate le frequenze alleliche e genotipiche di questa popolazione. secondo voi questa popolazione rispetta l'equilibrio hardy weinberg relativamente al locus B?

per primo calcolo le frequenze genotipiche della popolazione rapportando i numeri di individui con un dato genotipo e il numero tot. degli individui
BB 96/10000= 0,001
Bb 1799/10000=0.18
bb 8002/10000=0,89

con la radice quadrata di BB trovo frequenza allelica B, con la radice quadrata del valore b trovo la frequenza allelica di b.
frequenza di B=0,03 frequenza di b=0,94 frequenze di Bb=0.18
non vi è un eqilibrio perche frequenza di Bb dovrebbe essere 2pq=0.06 essendo b=0.94 e B=0.03 0.06

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 26 gennaio 2009 : 17:24:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
non vi è un eqilibrio perche frequenza di Bb dovrebbe essere 2pq=0.06 essendo b=0.94 e B=0.03 0.06

E come fai a dire che le differenze che vedi non siano semplicemente casuali?

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ercole
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44 Messaggi

Inserito il - 26 gennaio 2009 : 17:28:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ercole Invia a ercole un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
quindi devo effetuare un test del chi quadro tra valori (osservati-attesi) quadro/ attesi solo che gli attesi non so come calcolari forse utilizzando l'equazione p quadro+ 2pq + q quadro
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 26 gennaio 2009 : 18:12:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Esatto (nota:non ho controllato se i calcoli sono corretti)

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


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Inserito il - 26 gennaio 2009 : 19:37:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da chick80

...(nota:non ho controllato se i calcoli sono corretti)

Li ho controllati io

Comunque non c'è "niente" di corretto, a partire dai dati dell'esercizio:

Citazione:
Messaggio inserito da ercole

in una popolazione formata da 10000individui. sono stati risultati i seguenti valori BB 99 bb 1799 bb 8002

99 + 1799 + 8002 = 9900 non 10000, mancano 100 individui!!!

Citazione:
Messaggio inserito da ercole

BB 96 99/10000= 0,001 0,01
Bb 1799/10000=0.18
bb 8002/10000= 0,89 0,80


Citazione:
Messaggio inserito da ercole

con la radice quadrata di BB trovo frequenza allelica B, con la radice quadrata del valore b trovo la frequenza allelica di b.

questo lo puoi fare solo se la popolazione è in equilibrio, altrimenti il binomio di HW non vale!

I seguenti conti non hanno senso perché è sbagliato il procedimento, comunque sono sbagliati:
Citazione:
Messaggio inserito da ercole

frequenza di B=0,03 RadQ(0,01)= 0,1


Comunque ricominciando da capo l'esercizio e mettendo dei dati coerenti:
N° individui 10000
BB 199
Bb 1799
bb 8002

Le frequenze alleliche le calcoli direttamente "contando" gli alleli:
fr(B) = N° alleli B/alleli totali
fr(B) = (199*2 + 1799)/20000 = 0,11
(oppure (199 + 1799/2)/10000)
fr(b) = (8002*2 + 1799)/20000 = 0,89
a questo punto la somma delle 2 frequenze alleliche fa 1.
Applichi il binomio di HW per calcolarti le "frequenze genotipiche attese", le "frequenze genotipiche osservate" è giusto calcolarle come hai fatto prima.
Infine come suggeriva chick80 fai un chi quadrato.
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ercole
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Inserito il - 26 gennaio 2009 : 19:56:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ercole Invia a ercole un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
(hw) frequenzegenotipiche attese= BB=0.11*0.11=0.0121*10000=121
bb=0.89*0,89=0.7921*10000=7921
Bb=0.89*0.11*2=0.1958*10000=1958

le frequenze attese da inserire nel test del chi quadro sono invece quelle riportate dai dati nell'esercizio
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


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Inserito il - 26 gennaio 2009 : 20:11:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
solo una piccola "precisazione" sui termini:

le "frequenze" non sono numeri interi, ma sono le percentuali espresse come 0,...

quindi le frequenze sono:
BB=0.0121
bb=0.7921
Bb=0.1958

Quelli che hai indicato sono il "numero" di individui.
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ercole
Nuovo Arrivato



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Inserito il - 26 gennaio 2009 : 20:48:58  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ercole Invia a ercole un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
scusami allora quelle calcolate sono le frequenze osservate e le frequenze attese come posso calcolarle per eseguire il chi quadro
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 27 gennaio 2009 : 22:12:34  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da ercole

scusami allora quelle calcolate sono le frequenze osservate e le frequenze attese come posso calcolarle per eseguire il chi quadro


Non usi le "frequenze" per il calcolo del chi quadrato ma usi il n° di individui!

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