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farmacologia
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Ignorante


100 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 13:15:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di farmacologia Invia a farmacologia un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve a tutti.
un collega mi ha inviato le seguenti sequenze di primer
FOR5 ggtactggtggagtatttgatagtg
REV5 AACACCTGCTTATACTAGGTTG
ed inoltre il seguente:
"N.B.:La seq del rev è da ordinare tal quale senza bisogno di fare inv e compl"
sapreste dirmi cosa intende per inv e compl?
grazie

Gabriele
Utente

Prov.: Pisa
Città: Pisa


615 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 13:35:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gabriele Invia a Gabriele un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
inversione e complementare

"Chi rinuncia alla libertà per la sicurezza, non merita né la libertà né la sicurezza. E finirà col perdere entrambe."
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Neuroscience
Utente



659 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:00:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Neuroscience Invia a Neuroscience un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
letteralmente senza fare il complementare, e senza invertirla

dato che nelle pcr c'è sempre un primer Forward che è la copia della sequenza di riferimento ed un Reverse che è complementare ed invertita rispetto alla sequenza... c'è sempre un po' di dubbio sul fatto che le sequenze dei primers che vengono trasmesse a qualcun altro siano la sequenza originale che amplificherà oppure sono state invertite.

Le sequenze vanno ordinate andando dall'estremità 5' all'estremità 3'

quindi quello che ti ha detto il tuo amico è che entrambe le sequenze sono in direzione 5' -> 3' già pronte da ordinare


Invertire è ABCD -> DCBA
Complementare è AAAAA -> TTTTT

Reverse è inverito e complementare, ovvero la sequenza dell'altro filamento del DNA in direzione 5' 3'




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farmacologia
Nuovo Arrivato

Ignorante



100 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:00:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di farmacologia Invia a farmacologia un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie, ma continuo a non capire.
nella scelta dei primer, perchè dovrei sceglierli facendo riferimento a termini come "inversione" o "complementare"?
forse per complementare posso arivarci se mi riferisco a "complementare della sequenza target sul frammento d'interesse" ma per inversione non trovo alcuna spiegazione.
ammetto l'ignoranza.
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Neuroscience
Utente



659 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:02:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Neuroscience Invia a Neuroscience un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ops, ho fatto un errore.... "letteralmente significa... complementare e invertirta"


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farmacologia
Nuovo Arrivato

Ignorante



100 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:03:33  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di farmacologia Invia a farmacologia un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie neuroscienze. mi hai anticipato nella seconda domanda
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marok
Utente Junior



150 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:03:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di marok Invia a marok un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma penso che te l'abbia detto per fugare ogni dubbio. Comunque meglio di quanto abbia fatto Neuroscience non si può spiegare.
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