qualcuno saprebbe risolvermi un piccolo dubbio: come si colloca la metionina iniziale (che in alcuni casi viene rimossa) rispetto ad esempio alla sequenza segnale N-term che indirizza le proteine verso la via secretoria? se la met è codificata dal codone di inizio AUG allora tutte le sequenze segnale dovrebbero cominciare con la met?
la metionina iniziale è rimossa nella quasi totalità dei casi; questo avviene in una delle prime fasi di modifica post traduzionale, ancor prima che il peptide signal all'N terminale sia individuato per l'indirizzamento della proteina. Per questa ragione le sequenze segnale generalmente non iniziano per Met.
grazie!!! pensavo ormai non mi rispondesse più nessuno...quindi le MAP cioè gli enzimi che tagliano la metionina iniziale, sono enzimi citosolici che agiscono prima che SRP si leghi a alla ss!
io invece pensavo che dato che poi cmq la ss viene clivata nel RE non ci fosse bisogno di clivare la iMet