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 Microarray :non riesco a capire bene
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Cris87
Nuovo Arrivato



24 Messaggi

Inserito il - 17 febbraio 2009 : 13:02:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Cris87 Invia a Cris87 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti mi sono da poco registrato.Allora il mio problema č questo:sto studiando a microbiologia la tassonomia batterica e un argomento č incentrato sull'uso dei microarray per,riporto le parole citate nel libro "BIOLOGIA DEI MICROORGANISMI" (Brock),ipotizzare la funzione di un gene in un batterio. In poche parole non ho capito bene la tecnica in questo caso come funziona.Ho cercato un pņ ovunque nel web ma non riesco a trovare una spiegazione che sia chiara e univoca per il caso che mi interessa,percui mi rivolgo a voi.In particolare secondo il libro la tecnica č questa:

1)"conoscendo le condizioni in riposta a cui un gene č trascritto,tale tecnica consente di ipotizzare la funzione di questo gene".Gią qui non ho capito cosa si conosce di questo gene (sequenza,posizione sul DNA???)

2)"sintesi di piccoli oligonucleotidi a singola elica". A partire da cosa??

3)"collocazione su posizioni note sul chip di DNA". Significa che ogni chip contiene un solo gene?

4)"ibridazione del chip con mRNA o cDNA marcati,relativi a condizioni di espressione genica diverse".Qui mi sono proprio perso...

5)fa poi vedere 2 array in cui in uno solo dei quali il gene X č espresso.

Quindi come potete vedere ho vari dubbi sulla tecnica in sč e infine mi chiedo:qual č il nesso fra il fatto che il geneX č espresso in un array e il voler ipotizzare la funzione del gene stesso??
Grazie mille per le risposte e scusate il poema

domi84
Moderatore

Smile3D

Cittą: Glasgow


1723 Messaggi

Inserito il - 17 febbraio 2009 : 14:13:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Mmm...penso tu possa trovare tutte le risposte che cerchi qui:
http://it.wikipedia.org/wiki/Microarray

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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Cris87
Nuovo Arrivato



24 Messaggi

Inserito il - 17 febbraio 2009 : 14:36:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Cris87 Invia a Cris87 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Mi dispiace Domi84,ma avevo gią controllato quel link ma non č quello che cercavo.
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domi84
Moderatore

Smile3D

Cittą: Glasgow


1723 Messaggi

Inserito il - 17 febbraio 2009 : 15:07:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:

Mi dispiace Domi84,ma avevo gią controllato quel link ma non č quello che cercavo.


Come no?!
Citazione:

1)"conoscendo le condizioni in riposta a cui un gene č trascritto,tale tecnica consente di ipotizzare la funzione di questo gene".Gią qui non ho capito cosa si conosce di questo gene (sequenza,posizione sul DNA???)


Con i microarray si conosce l'espressione di un gene. Se ad esempio togli ossigeno ai batteri avrai l'aumento di espressione di alcuni geni coinvolti in quella funzione...per maggiori info:
http://it.wikipedia.org/wiki/Microarray
Citazione:

2)"sintesi di piccoli oligonucleotidi a singola elica". A partire da cosa??


I microarrey sono fatti da migliaia di piccoli oligonucleotidi a singola elica, sono complementari a geni o comunque a tratti di DNA (nel tuo caso saranno complementari a geni batterici). Per maggioni info:
http://it.wikipedia.org/wiki/Microarray
Citazione:

3)"collocazione su posizioni note sul chip di DNA". Significa che ogni chip contiene un solo gene?


Ogni chip ha migliaia di geni, ogni posizione č conosciuta. Per maggiori info:
http://it.wikipedia.org/wiki/Microarray
Citazione:

4)"ibridazione del chip con mRNA o cDNA marcati,relativi a condizioni di espressione genica diverse".Qui mi sono proprio perso...


Dovresti leggere questo paragrafo qua:
http://it.wikipedia.org/wiki/Microarray#Spotted_microarrays
Citazione:

5)fa poi vedere 2 array in cui in uno solo dei quali il gene X č espresso.


Non so...magari sarą un microarray non stimolato, e un altro con un determinato stimolo. quindi il gene X č in risposta a quel determinato stimolo...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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