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biotecman
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40 Messaggi

Inserito il - 27 febbraio 2009 : 10:57:20

piccolo dubbio sugli array di oligonucleotidi

Negli array di oligonucleotidi ho studiato che per ogni trascritto ci sono dei probe di 25 nt che lo coprono per intero o quasi...

Ma la nostra sonda, deriva sempre da cDNA ottenuto per RT?...i frammenti della sonda non saranno molto pi� grandi rispetto alle probes fissate sul vetrino? non sarebbe pi� conveniente spezzettare la sonda?

e ancora per quanto riguarda la correzzione PM - MM (perfect match - mismatch) il prof ha detto che ora non si usa pi� e si usa un'unico oligo, in particolare ha parlato di exon array con un'unica probe per ciascun esone...qualcuno sa qualche informazione in pi�?

Ultima domanda: come fare per lo splicing alternativo? come faccio a sapere che l'intensit� del trascritto X � dovuta all'abbondanza o allo splicing alternativo?

grazie