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RNA world
Utente Junior
370 Messaggi |
 Inserito il - 24 marzo 2009 : 14:51:40
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ciao a tutti,
con Pymol si possono tracciare le linee che congiungono due atomi che formano una certa interazione, ad esempio tra la catena laterale di un aa e un atomo del ligando. Per fare questo basta selezionare le due molecole, poi Action-->Find-->Polar Contact-->whithin selection.
A volte pymol non è capace di trovare tutti i contatti che realmente ci sono, quindi come si fa ad unire due atomi tramite gli stessi "trattini" facendolo manualmente, cioè selezionando i due atomi ad esempio?
grazie
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Pymol: tracciare i Polar contacts
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