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federico.marrone
Nuovo Arrivato

Prov.: PA
Cittā: Palermo


2 Messaggi

Inserito il - 17 aprile 2009 : 12:45:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di federico.marrone Invia a federico.marrone un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buongiorno a tutti,
qualcuno sa come ottenere una restituzione grafica di minimum spanning network partendo dal file output in formato testo? (nel mio caso da Arlequin v. 3.11).
Non posso credere che si debba davvero realizzare a mano usando excel e paint!
Aiuto!
Federico

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 17 aprile 2009 : 14:41:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Puoi dare una occhiata a questo topic di un forum in inglese:
- gsf.gc.ucdavis.edu/viewtopic.php?f=8&t=526
(se non funziona, prova da qui

In questo momento, non ho esattamente chiaro cosa sia un minimum spanning network e come crearlo.
Pero', una grande applicazione per visualizzare networks é cytoscape:
- http://www.cytoscape.org/
Puoi vedere se riesci a convertire l'output del tuo programma in una compatibile con cytoscape (anche un csv andrebbe bene) e a leggerlo da lí.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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