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acidnuk
Nuovo Arrivato
Prov.: Palermo
2 Messaggi |
 Inserito il - 16 marzo 2006 : 20:48:41
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Innanzitutto ciao a tutti visto che sono fresco di registrazione e complimenti per il forum che io ho scoperto da 2gg.....
ho un problema da risolvere in ..diciamo..3 gg.
Devo consegnare la mia tesi lunedì (laurea quinquennale), e mi servirebbero dei consigli su un sito che nn sia pubmed e affiliati,in cui posso trovare molto sulle funzioni delle proteine ma in modo diretto senza perdere tempo a leggere articoli.....
in pratica ho fatto la tesi utilizzando un dominio della apob-100 come bait per il sistema two-hybrid e lo screening della liver library, ho ottenuto molti cloni positivi e adesso dovrei vedere se alcuni sono interessanti dal punto di vista funzionale.
nn mi chiedete come mai sono arrivato a 3gg dalla consegna senza averci lavorato prima perchè già ho l'ulcera al sol pensiero....
ciao e grazie in anticipo!
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data
Nuovo Arrivato
Prov.: Torino
Città: Torino
89 Messaggi |
Inserito il - 16 marzo 2006 : 21:48:12
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Uh?
Se proprio non vuoi ncbi cerca il nome delle proteine su http://www.ensembl.org, da lì puoi seguire vari link...oppure puoi farti un'idea molto rapida guardando i termini GO (Gene Ontology) associati alle singole proteine (sono cose come: Cell Cycle, Mitosis, Migration, Adhesion...poi sulle ontologie ci sarebbe molto da dire ma ora forse non ti interessa): l'aggregatore più rapido di info che hai dei db ncbi per questo tipo di informazioni potrebbe essere Entrez Gene (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene).
HTH |
http://www.medito.eu.org/vodka/odierno |
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acidnuk
Nuovo Arrivato
Prov.: Palermo
2 Messaggi |
Inserito il - 16 marzo 2006 : 22:48:45
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| ok grazie provo subito!! |
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 17 marzo 2006 : 12:39:28
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Potresti usare PIR (Protein Information Resource): http://pir.georgetown.edu/pirwww/search/textsearch.shtml , per la ricerca di informazioni generali su una proteina.
Una volta che hai individuato la sequenza che ti interessa, devi cliccare sul link 'UniprotKB/TrEMBL' sotto il suo nome, per accedere al record di Uniprot.
Stranamente, pero' sembra che al momento il sito www.uniprot.org non sia accessibile: mah!!
In alternativa puoi accedere al record di expasy (www.expasy.org, o www.expasy.org/srs5), e se scorri la pagina gialla che ti compare per ogni sequenza, trovi una sezione chiamata 'Comments' che spiega molto sinteticamente la funzione della proteina: http://www.expasy.org/uniprot/P04114#comments
ciao! |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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ciao a tutti :-) ho un problema :-( ...two-hybrid
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