Informazioni su Domini Proteici[era: an. proteina]

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Discussione

giovarusso76
Nuovo Arrivato

23 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2006 : 11:25:44

analizzando una proteina(epidermal growth factor) ho trovato dei domini egf_3 (egf-like domain), egf_2 (egf-like domain signature 2), egf_1 (egf-like domain signature 1),egf_ca (calcium bunding egf-like domain signature).
Qualcuno mi da' qualche chiarimento su differenze e funzione dei domini?

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2006 : 12:14:44

Cosa hai utilizzato per identificare questi domini?

La soluzione piu' semplice e' cercare questi domini in PROSITE da questi link: http://www.expasy.org/prosite/
Per esempio uno dei domini che hai postato e' questo:
http://www.expasy.org/cgi-bin/prosite-search-ac?PDOC00021

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

giovarusso76
Nuovo Arrivato

23 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2006 : 12:18:39

ho usato proprio prosite,ma non capisco la differenza tra questi e la loro funzione...putroppo ne capisco molto poco di biologia molecolare

pierduemila
Nuovo Arrivato

Prov.: Milano
Citt�: milano

2 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2006 : 17:03:07

Citazione:
Messaggio inserito da giovarusso76

analizzando una proteina(epidermal growth factor) ho trovato dei domini egf_3 (egf-like domain), egf_2 (egf-like domain signature 2), egf_1 (egf-like domain signature 1),egf_ca (calcium bunding egf-like domain signature).
Qualcuno mi da' qualche chiarimento su differenze e funzione dei domini?

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 21 marzo 2006 : 16:01:05

Ok che hai fatto una citazione pierduemila, ma il commento?

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada

pierduemila
Nuovo Arrivato

Prov.: Milano
Citt�: milano

2 Messaggi

Inserito il - 22 marzo 2006 : 17:09:42

Per la ricerca di funzioni di domini consiglio ProDom o Pfam sono abbastanza completi.