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Evil
Nuovo Arrivato
67 Messaggi |
 Inserito il - 30 maggio 2009 : 11:12:20
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Qual'è il motivo per il quale durante lo scambio di esoni tra trascritti di pre-mRNA non si generano (o comunque in rari casi) trascritti con open reading frame shiftati?
Per essere più chiari, come mai gli introni che circondano l'esone nel complesso "introne esone introne" che si stacca tendono a non alterare il quadro di lettura dell'esone che incorporano e degli esoni successivi del trascritto nel quale si andranno ad integrare?
Mi salta in mente che tutto deve essere fatto in modo che il trascritto finale sia multiplo di 3 in basi, ma supponendo che il complesso introne-esone-introne si limiti ad essere sempre multiplo di 3 nel caso in cui il questo si inserisca all'interno di un codone (spezzando una tripletta) nel trascritto target, creerebbe comunque una modifica dell'ORF..
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zerhos
Utente Junior
Prov.: Pisa
Città: Pisa
421 Messaggi |
Inserito il - 30 maggio 2009 : 19:25:26
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mmmm,creo tu stia sbagliando il modo di vedere la cosa...
per parlare di frame alterato,devi avere un frame "fisiologico" di partenza,mi segui?
dire che lo splicing possa alterare il frame nn ha senso,perchè il frame di lettura non è altro che il prodotto finale di tutto il processamento dell'mRNA.alla fine ottieni una certa sequenza amminoacidica.
Ora se questa sequenza per qualche ALTRO motivo viene a cambiare,allora ha senso parlare di cambio di lettura.
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"l'unica differenza tra me e un pazzo è che io non sono pazzo!"
Salvador.Dalì
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Evil
Nuovo Arrivato
67 Messaggi |
Inserito il - 30 maggio 2009 : 20:01:28
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si ti seguo, ma mi voglio scusare perchè non parlavo di splicing, avevo studiato male la cosa, avviene nel DNA non nei trascritti, parlavo di shuffling esonico, complessi introne-esone-introne che da una regione del DNA si copiano in un'altra (all'interno di un'altro gene). Ad esempio durante il crossing-over
questo per intenderci http://en.wikipedia.org/wiki/Exon_shuffling
(grazie comunque per la risposta) |
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zerhos
Utente Junior
Prov.: Pisa
Città: Pisa
421 Messaggi |
Inserito il - 30 maggio 2009 : 23:40:20
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mmmm interessante....ma nn mi hai seguito :p
non importa quello che succede a monte,il risultato è che a valle tu avrai una certa sequenza e il fatto stesso che essa esista significa che è passata al vaglio evolutivo perchè dalla lettura ne esce fuori una proteina correttamente funzionante.
quello che cerco di dirti è che devi preoccupari del prodotto finito e non del prodotto in corso d 'opera,queste ricombinazioni a monte porteranno sicuramente a delle variazioni nel frame di lettura a valle e non necessariamene saranno aggiunte/sottrazioni di un numero di nt multiplo di 3,quello che conta è alla fine che ottieni una certa sequenza,che se vuoi puoi vederla come un alterazione dell' originale, magari che codifica per un nuovo enzima utile all'organismo,spetta poi all'ambiente selezinare questa nuova variazione.
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"l'unica differenza tra me e un pazzo è che io non sono pazzo!"
Salvador.Dalì
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Evil
Nuovo Arrivato
67 Messaggi |
Inserito il - 31 maggio 2009 : 11:22:32
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| si hai ragione, mi manca ancora questo tipo di ragionamento :) grazie mille! |
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Shuffling esonico (multipli di 3?)
Didattica
