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 indice idropatico di un aminoacido
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DonJuan
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1 Messaggi

Inserito il - 25 luglio 2009 : 16:11:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di DonJuan Invia a DonJuan un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti.
Qualcuno saprebbe dirmi cos'è l'indice idropatico di un aminoacido?

Grazie mille

berenike
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2 Messaggi

Inserito il - 20 agosto 2009 : 17:42:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di berenike Invia a berenike un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
L'indice idropatico è un numero che rappresenta le proprietà idrofobiche o idrofile della catena laterale di un amminoacido. Maggiore è il numero, più idrofobico è l'amminoacido. I valori di idropatia vengono utilizzati per predire quali posizioni della catena proteica si troveranno in zone interne dove non avranno contatto con l'acqua. Spero di essere stata chiara..
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pattylove
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65 Messaggi

Inserito il - 21 agosto 2009 : 12:44:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di pattylove Invia a pattylove un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
calcolando l'idrofobicità media di una finestra di amminoacidi si può capire se si tratta di una proteina di membrana o no. In quanto se troviamo un numero di residui aa idrofobici >20 allora si tratta di una proteina di membrana perchè questa è caratterizzata da alfa eliche e quindi aa idrofobici (superiore a 20) che formano i segmenti transmembrana.
Il sistema è un sistema di assi cartesiani con in ascissa il numero di aa (le posizioni) e in ordinata troveremo una scala di numeri positivi(aa idrofobici) e negativi (aa idrofilici).
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