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Autore

Discussione

mikeee
Nuovo Arrivato

18 Messaggi

Inserito il - 14 agosto 2009 : 10:45:28

Ciao,
qualcuno conosce per caso qualche tool online per convertire i file RefSeq in fasta?
grazie!

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 14 agosto 2009 : 11:33:54

Allora, per essere precisi RefSeq è un database, non un formato di sequenze, per questo ti è difficile a trovare un tool per la conversione

Probabilmente le tue sequenze sono in formato EMBL o GenBank.

In ogni caso, credo che si possa rispondere in maniera simile a questa domanda:

Citazione:
Hai tante opzioni:
- puoi scaricare jalview e convertirle manualmente (http://www.jalview.org/download.html)
- usare un tool online come questo (basato su emboss): http://searchlauncher.bcm.tmc.edu/seq-util/readseq.html

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)