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 Sondaggio concentrazione dNTPs
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selene.mo
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 01 settembre 2009 : 23:01:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di selene.mo Invia a selene.mo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao raga,
mi annoio e quindi vorrei fare un sondaggio...

Secondo voi, se dico che i miei dNTPs sono 20mM, significa che ogni xTP ha concentrazione 20mM o 5mM ?

Io voto che ogni xTP ha concentrazione 20mM! Alla faccia del tecnico del mio laboratorio che la pensa nell'altro modo e che mi fa gli stock sbagliati! :D

Dionysos
Moderatore

D

CittÓ: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 01 settembre 2009 : 23:17:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Secondo me hai ragione tu, Ŕ riferito alla concentrazione
di ognuno dei quattro singoli deossiribonucletidi.

In effetti non esiste "una mole di nucleotidi" : ogni
specie chimica forma delle moli con molecole a sÚ identiche!

Volere libera : questa Ú la vera dottrina della volontÓ e della libertÓ
(F.W. Nietzsche)

Less Jim Morrison, more Sean Morrison!


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chick80
Moderatore

DNA

CittÓ: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 01 settembre 2009 : 23:20:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io intendo 20 mM di ciascuno, non ha senso sommare le [] di sostanze diverse.

Ad ogni modo per evitare disguidi basta dire "dNTP, 20mM each" :D

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selene.mo
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 01 settembre 2009 : 23:27:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di selene.mo Invia a selene.mo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Certo che esiste una mole di dNTPs! Se intendi come dNTPs l'allegra famiglia stretta a braccetto di A+T+G+C. Basta immaginarseli tutti insieme come una unica molecola, ed ecco che una mole di dNTPs significa 1 mole di dATP + 1 mole di dTTp + 1 mole di dGTP + 1 mole di dCTP ! La cosa frustrante Ŕ che il tecnico del mio laboratorio non mi vuole ascoltare, provo a spiegarle il ragionamento che c'Ŕ dietro e non mi da retta e continua a fare di testa sua, sbagliando!
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GFPina
Moderatore

GFPina

CittÓ: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 01 settembre 2009 : 23:37:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Stavo rispondendo ma ho problemi di connessione, nel frattempo hai avuto altre risposte.
Io intenderei 20mM di ognuno ma Ŕ sempre bene specificare! Le mix di dNTPs possono essere indicate sia come molaritÓ di ogni singolo dXTP (e quindi si scrive "each") ma possono anche essere indicate come molaritÓ totale (e viene indicato con "total"), ad es. http://www.lightlabsusa.com/product.php?productid=16208 (giusto il primo uscito da una ricerca)

in genere attorno ai 20mM Ŕ "each" e attorno a 100mM Ŕ "total", ovviamente questa non Ŕ assolutamente una regola ma sono le soluzioni pi¨ comuni che si trovano in commercio!

BTW Ŕ possibile anche inserire unvero e proprio sondaggio al posto di una discussione normale basta che clicchi su Nuovo Sondaggio

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Utente Junior



565 Messaggi

Inserito il - 02 settembre 2009 : 11:19:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lÓ Invia a lÓ un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
io intendo 20mM di ognuno!!!
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Neuroscience
Utente



659 Messaggi

Inserito il - 02 settembre 2009 : 12:08:47  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Neuroscience Invia a Neuroscience un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
diciamo che sarebbe difficile difendere il punto di vista di 20 mM di dNTP totali.
sarebbe come se io intendessi KCl 1 M sommando gli ioni di cloro 0,5 M e potassio 0,5 M.

A meno che non sia diversamente specificato la si dovrebbe intendere come la concentrazione di ogni singolo nucleodide.
Per˛ puoi risolvere la situazione in maniera salomonica facendo aggiungere la dicitura total.

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GFPina
Moderatore

GFPina

CittÓ: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 02 settembre 2009 : 12:53:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Neuroscience

Per˛ puoi risolvere la situazione in maniera salomonica facendo aggiungere la dicitura total.

immagino intendessi "each" (in questo caso)

Comunque concordo, sempre meglio specificare!
Anche se in realtÓ non ha senso "sommare" le molaritÓ dei diversi dNTPs, spesso viene fatto (anche dalle case che vendono le mix di dNTPs) e pu˛ generare confusione.

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Neuroscience
Utente



659 Messaggi

Inserito il - 02 settembre 2009 : 13:14:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Neuroscience Invia a Neuroscience un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
uhmm... avevo capito che il tecnico prepara le soluzioni 20 mM dNTP (5 mM each)
dato che non vuole scrivere 5 mM each, potrebbe almeno aggiungere 20 mM total
per˛ ci siamo capiti

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GFPina
Moderatore

GFPina

CittÓ: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 02 settembre 2009 : 13:52:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ah ok, l'abbiamo presa da un punto di vista differente!
Io intendevo che "lei" vuole che la mix che sia 20mM each ma il tecnico la prepara 5mM each (20mM total) quindi lei dovrebbe specificare che la vuole 20mM each.
Tu invece intendi che "il tecnico" dovrebbe specificare che la soluzione che ha preparato Ŕ 5mM each (o 20mM total).
Il discorso non cambia, ma... abbiamo dato un'ottima dimostrazione pratica di come questo possa generare confusione!
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gilthanas
Nuovo Arrivato

0116_da_CIA



100 Messaggi

Inserito il - 04 settembre 2009 : 17:32:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di gilthanas Invia a gilthanas un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
tutta la vita 20uM each...non ha senso sommarli...
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