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fema
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Inserito il - 07 settembre 2009 : 15:45:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fema Invia a fema un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
come si forma il legame anidridico tra ADP + P NEL COMPLESSO 5? nel momento in cui i protoni rientrano secondo gradiente nella matrice mitocondriale cosa avviene? vorrei capire come si muovono le subunità alfa e beta!!grazie

tittideby
Nuovo Arrivato



65 Messaggi

Inserito il - 08 settembre 2009 : 13:56:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di tittideby Invia a tittideby un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao fema spero di essere chiara e soprattutto di poterti aiutare...allora immagino tu conosca la struttura del complesso in ogni caso lo accenno brevemente.
due componenti lo formano Fo e F1.La prima è lo statore cioè la parte mobile,proteina di membrana,la seconda è la parte mobile del complesso.La F1,appunto,ha 3sub beta e 3 alfa,(alternate), una sub gamma che connette le beta e alfa alla Fo,una sigma (tipo bracccio che collega)e una epsilon su cui poggia la gamma. Le beta più le afa formano il così detto spicchio d'arancia del complesso.Le sub beta sono le catalitiche quelle alfa le non catalitiche.Adesso...nel momento in cui il gradiente protonico si è accumulato per successivo trasferimento di eq riducenti attraverso i diversi complessi,un protone attraversa la porzione Fo.Il passaggio di qsuesto protone consente alla subunità gamma(una sorta di stelo) di ruotare in senso antiorario per 120 gradi per ogni protone.Questo movimento genera energia necessaria per far avvenire il cambiamento di conformazione delle subunità catalitiche beta (dello spicchio d'arancia).queste infatti,saprai,si trovano in 3 diverse conformazioni L - T - O .La L lega debolmente ADP e Pi ,la T lega saldamente l'ATP e la O è la forma aperta,cioè libera.Come cambiano qst conformazioni??L sintetizza ATP quindi cambia in forma T.O cambia in forma L legando quindi ADP e Pi.T cambia in O cedendo l'ATP che legava.
Quindi immagina che man mano che passano i protoni le subunità cambino conformazioni in una sorta di meccanismo ciclico.Quella che era T diventa O,quella che era O diventa L e quella che era L diventa T.
La formazione di ATP AVVIENE COME SEMPRE,cioè il legame è lo stesso che avviene sempre ogni volta che si forma ATP.
Solo un piccolo appunto da alcuni calcoli che non ti faccio ma se vuoi ti spiego risulta che per sintetizzare una molecola di ATP servono circa 50 kJ\mole quindi circa 3 protoni.....per cui poichè per ogni protone avevi 120 gradi di rotazione antioraria...avrai 360 di rotazione antioraria della sub beta per la sintesi di ATP.
Il discorso è un po' complicato...non posso rileggere perchè sono di fretta,spero di averti aiutata,fammi sapere se hai altri dubbi.
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fema
Nuovo Arrivato

Prov.: lecce


5 Messaggi

Inserito il - 08 settembre 2009 : 15:30:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fema Invia a fema un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie... sei stata chiarissima.. anche se io sapevo che ci vogliono almeno quattro protoni x sintetizzare una molecola di ATP. ma il concetto l'ho capito perfettamente... grazie ancora.. se ho ancora qualche dubbio posso chiedere?? mi saresti di grande aiuto!! purtroppo ho l'esame di biochimica a breve!!! un bacio..
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tittideby
Nuovo Arrivato



65 Messaggi

Inserito il - 09 settembre 2009 : 00:48:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di tittideby Invia a tittideby un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie a te per i complimenti,sono contenta di averti aiutata,forse nei quattro avevi erroneamente incluso quello che serve al TAN per allontanare ATP e far passare ADP.Chiedi pure....e in bocca al lupo per l'esame,anche io dovrò affrontarlo,ormai biochimica 3....quando vuoi!
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 09 settembre 2009 : 08:29:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
In realtà se non ricordo male il numero di protoni per molecola di ATP è ancora un po' dibattuto, quindi (per il momento) avete ragione entrambe!

Non conosco bene la letteratura a riguardo, ma ad es:
H+/ATP ratio of proton transport-coupled ATP synthesis and hydrolysis catalysed by CF0F1-liposomes.

Dall'introduzione

Citazione:
numbers between two and four were reported for the H+/ATP ratio, which is the number of protons transported through the enzyme per ATP synthesized (Schwartz, 1968; Junge et al., 1970; Hangarter and Good, 1982; Mills and Mitchell, 1982; Davenport and McCarty, 1984; Strotmann and Lohse, 1988; Van Walraven et al., 1996).


e dalle conclusioni

Citazione:
The H+/ATP ratio, defined as the number of protons necessary to synthesize one ATP at equilibrium, is four, according to the data of the present work. Given the stoichiometry of three beta-subunits per CF0F1 and the stoichiometry of 14 subunits III per CF0F1, as recently determined in isolated subunit III complexes (Seelert et al., 2000; Müller et al., 2001), their ratio becomes 14/3 approximately 4.7. This difference might indicate that the stoichiometric ratio of subunits does not represent the H+/ATP ratio, or that the subunit stoichiometry in the isolated subunit III-ring is different from that in intact CF0. As has been pointed out previously (Ferguson, 2000; Seelert et al., 2000; Stock et al., 2000), the H+/ATP ratio might vary between different species. A value of 4 for the mitochondrial enzyme would result in a P/O ratio of 2 for NADH oxidation and 1.2 for succinate oxidation, in striking contrast to the experimentally determined values of 2.5 and 1.5, respectively, which agree instead with an H+/ATP of 3. As those authors emphasize, the ratio between 3 and 4 H+/ATP is very similar to the ratio of 10 to 14 subunits c, as found in the mitochondrial (Stock et al., 2000) and chloroplast (Seelert et al., 2000) enzyme, respectively. However, as the data of the present work indicate, the issue of c/beta stoichiometry versus H+/ATP stoichiometry remains, thus far, still open. Therefore, for an understanding of how proton movement through F0 drives ATP synthesis in F1, both parameters, on one side the c-subunit stoichiometry and on the other side the H+/ATP ratio, need to be the subject of careful investigations in different species.


O anche, più recente:
The thermodynamic H+/ATP ratios of the H+-ATPsynthases from chloroplasts and Escherichia coli.

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