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tambua
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Inserito il - 14 ottobre 2009 : 11:40:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di tambua Invia a tambua un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Piccola domanda:

Dopo una PCR supponendo di voler purificare il prodotto di amplificazione da contaminanti di vario tipo (prodotti aspecifici, incompleti) mediante gel-elettroforesi per una successiva ligazione in un vettore, come si può procedere?
Il buffer di partenza non deve essere sostituito con uno compatibile con la corsa e poi successivamente con la ligazione?

GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 14 ottobre 2009 : 12:18:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Non ho capito benissimo la tua domanda.
Comunque il genere quello che puoi fare è seminare il prodotto di PCR su un gel e dopo l'elettroforesi excidere dal gel la banda contenente il tuo amplificato, purificarlo e poi procedere alla ligazione.

Non mi è chiaro il tuo discorso sui buffer comunque ovviamente in ogni passaggio utilizzi i buffer appropriati, ma non è che li sostituisci: per seminare il prodotto di PCR gli aggiungi il sample buffer che conterrà glicerolo (o saccarosio) per far precipitare il campione nel pozzetto e uno o più coloranti per seguire la corsa.
Poi una volta estratto il frammento dal gel, quando devi fare la ligazione userai il buffer per la ligazione.

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tambua
Nuovo Arrivato



50 Messaggi

Inserito il - 14 ottobre 2009 : 13:16:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di tambua Invia a tambua un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sono stato di una imprecisione unica nel formularti la domanda, comunque la risposta che mi hai fornito era esattamente quella che desideravo.

A buon rendere green fluorescent Pina
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 14 ottobre 2009 : 14:38:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ok bene!
Citazione:
A buon rendere green fluorescent Pina
Oh mi fa piacere che ognitanto ci sia qualcuno che capisce il mio nick!
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