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myryam
Nuovo Arrivato
15 Messaggi |
 Inserito il - 23 ottobre 2009 : 17:13:08
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che differenza cè fra mappa genetica e fisica? a che serve il linkage?? xkè la mappa genetica può essere + lunga di qlla fisica??Grazie a tutti
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paolo865
Utente Junior
Prov.: Como
Città: Olgiate Comasco
262 Messaggi |
Inserito il - 23 ottobre 2009 : 17:39:37
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| penso che sul forum troverai altre spiegazioni, cmq la mappa genetica si basa sul calcolo delle frequenze di ricombinazione, e quindi calcola la distanza tra due caratteri in centiMorgan, mentre quella fisica come dice la parola si basa sul calcolo della distanza in Megabasi, kilobasi fino al pb nel caso del sequenziamento (la risoluzione dipende dal tipo di metodologia usata per costruire la mappa fisica es. ibridi somatici, ibridi di radiazione etc).La mappa genetica non corrisponde sempre a quella fisica, infatti per esempio due caratteri possono avere una bassa frequenza di ricombinazione, e sembrarti dunque vicini in cMorgan, ma questo può dipendere solo dal fatto che si trovino in Hot spot di ricombinazione, e quindi in realtà i due caratteri sono lontani. infine l'analisi di linkage serve per studiare come segregano due caratteri all'interno di una famiglia e dallo studio dei ricombinanti capire se sono vicini o lontani geneticamente (il tutto poi va confermato con analisi statistica vedi Lod score). Scusa se magari sono stato trtoppo breve e non esauriente ma il discorso è lungo e non avevo molto tempo..cmq su internet trovi diverso materiale su cui approfondire..nel caso in cui hai degli altri dubbi chiedi pure..ciao |
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alessiasco
Nuovo Arrivato
Città: Roma
2 Messaggi |
Inserito il - 31 ottobre 2009 : 10:39:37
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Ciao myryam, anche se breve, Paolo è stato molto chiaro. Volevo aggiungere solo un altro concetto : la mappa genetica e la mappa fisica non sempre corrispondono pechè con la mappa genetica, noi lavoriamo con le frequenze di ricombinazione e quindi potrebbero esserci dei doppi ricombinanti che danno orighine di nuovo a genotipi di tipo parentale e quindi non verranno considerati neella conta dei ricombinanti per cui ci può essere una sottostima della distanza. Però l'ordine dei geni tra mappa genetica e fisica è uguale.
Ciao |
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germy
Nuovo Arrivato
74 Messaggi |
Inserito il - 31 ottobre 2009 : 14:53:30
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spesso nn si parla di come e due mappe siano correlate, infatti anche se non abbiamo una corrispondenza esatta tra CENTIMORGAN e PAIA DI BASI, l'utilizzo di un mappaggio genetico e funzionale sono delle tecniche complementari.
Ad esempio se voglio conoscere un gene malattia(del quale so approssimativamente ad esempio che si trova sul braccio q del cromosoma TOT), devo necessariamente associarlo ad altri marcatori per conoscerne l'ordine corretto; il bello è che di questi marcatori (che possono essere RFLP,SNP,VNTR) si conosce esattamente il luogo in cui si trovano, quindi conoscendo il linkage di questi nei confronti del nostro locus ignoto possiamo enormemente restringere a livello fisico la ricerca della sequenza. Una volta ottenuta la sequenza che conterrà il gene si possono effettuare tantissimi test per identificare correttamente il locus e la mutazione che lo rende non funzionante come ad esempio test di complementazione e sequenziamento.
spero di nn aver sparato qualke balla...ditemelo se no! che ho l'esame tra pochi giorniiiiiiiiii |
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linkage, mappe genetiche e fisiche.
