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michela
Nuovo Arrivato
Prov.: Reggio Emilia
23 Messaggi |
 Inserito il - 30 maggio 2006 : 15:55:28
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Ciao a tutti!
avrei bisogno di qualche suggerimento da parte vostra, espertoni in informatica ed affini.
Dunque, riassumendo, tra qualche mese una collega tornerà da un periodo all'estero con una grande quantità di dati ottenuti con analisi microarray:dati di quantificazione e anche immagini delle scansioni credo.
Partendo dal presupposto che le mie conoscenze informatiche sono piuttosto di base, potreste suggerirmi un modo razionale e non eccessivamente astruso per conservare e gestire questa mole di dati?
Insomma voi al mio posto, come organizzereste il tutto?
Pare che verrà acquistato anche un nuovo pc per questo, quali quindi le caratteristiche migliori (a parte un fracco di memoria ovviamente!)?
Mi scuso se la questione può sembrare banale (e magari lo è davvero), ma definirmi neofita della materia sarebbe già moltissimo e una qualche dritta da parte di qualcuno sarebbe una manna!
Inoltre, se per caso dovessi appassionarmi alla bioinformatica(qualcuno dice che non è mai troppo tardi per una nuova passione!), cosa mi suggerireste di leggere????
Ecco è tutto, spero di non chiedere troppo!!!
Grazie a tutti!
Michela
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
 Inserito il - 01 giugno 2006 : 10:38:30
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Benvenuta in questo forum!
Il mio consiglio è quello di utilizzare un formato già adottato da un'altra banca dati esistente: ormai ce ne sono tanti, tipo kegg - expresion, ArrayExpress, o tutti quelli che puoi trovare anche semplicemente su google.
Inoltre anche per i formati c'è ricerca, quindi se provi a vedere su pubmed (es. [url='http://www.hubmed.org/search.cgi?q=\"microarray file format\"~10']http://www.hubmed.org/search.cgi?q="microarray file format"~10[/url] o http://www.scirus.com/srsapp/search?q=microarray+file+format ), trovi qualche articolo.
In genere le banche dati prima di essere realizzate vengono progettate attraverso tre stadi successivi (schema concettuale, logico e fisico); quindi ti conviene cercare su Internet qualche appunto di un corso di Basi di dati (tipo http://www.cs.unibo.it/~montesi/Bioinfo/ , lez. 5) per capire almeno cosa significano e come funzionano. |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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michela
Nuovo Arrivato
Prov.: Reggio Emilia
23 Messaggi |
Inserito il - 07 giugno 2006 : 12:35:04
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Ti ringrazio molto della risposta: guarderò ciò che mi hai consigliato e proverò a saltarci fuori!
Grazie ancora!
M- |
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