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msss_barbara
Nuovo Arrivato
15 Messaggi |
 Inserito il - 11 gennaio 2010 : 18:08:36
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Salve!
Devo effettuare un'analisi delle corrispondenze multiple su dei dati relativi ad un questionario.
Vi elenco il mio elaborato:
1)carico i dati
Successivamente:
2)installo la library(ca) per l'analisi, mando in esecuzione ed in console appare "Carico il pacchetto richiesto: rgl".
Carico il pacchetto come richiesto, ma appare un nuovo warning:
> utils:::menuInstallPkgs()
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
Warning: package 'rgl' is in use and will not be installed
come ovviare a tale impedimento??
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 11 gennaio 2010 : 18:18:13
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Dovrebbe essere solo un warning. Se il pacchetto 'rgl' è giá in uso, vuol dire che è anche giá installato e probabilmente non è necessario aggiornarlo.
Potresti scrivere qui la storia dei comandi che hai dato e il loro output, affinchè possiamo riprodurre l'errore? |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 11 gennaio 2010 : 18:43:53
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Oppure la libreria ca richiede rgl e tenta di installarlo (perchè forse non è installato?)
Prova a fare:
install.packages("rgl")
Una volta installato non dovresti (forse) avere più il problema
Puoi anche usare
installed.packages()
per ottenere una lista dei pacchetti installati |
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msss_barbara
Nuovo Arrivato
15 Messaggi |
Inserito il - 11 gennaio 2010 : 19:10:45
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Grazie ad entrambi! Siete gentilissimi!
Allora, i comandi che ho dato in input sono:
library(RODBC)
co <- odbcConnectExcel("C:/Users/admin/Desktop/codifica_dati.xls")
co
dati <- sqlFetch(co,"campione_osservato")
summary(dati)
odbcClose(co)
library(rgl)
library(ca)
x chick80, avevo provato ad installare il pacchetto "rgl", ma sembrava non riconoscerlo. Ora non mi dà più quel messaggio.
In compenso, quando inserisco i comandi per fare l'analisi:
acm<-mjca(dati, lambda="adjusted")
acm
Mi dà quest'altro errore:
Errore: cannot allocate vector of size 198.5 Mb
> acm
Errore: oggetto "acm" non trovato
> acm
Capisco che il file potrebbe sembrare grande, ma come posso continuare la mia analisi???
Purtroppo non ho avuto molto a che fare con R in passato.
Vi ringrazio.
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 11 gennaio 2010 : 19:16:40
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| Eh sì, quell'errore vuol dire che il file è troppo grande e non hai abbastanza memoria per gestirlo, quindi la variabile acm non viene creata. Devi per forza leggere i dati tutti in una volta? |
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msss_barbara
Nuovo Arrivato
15 Messaggi |
Inserito il - 11 gennaio 2010 : 20:26:01
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Non capisco se sono io, oppure il mio R è andato ^_^
Ho provato a considerare una sottomatrice del file originario (per ridurne la capacità), per vedere se almeno con quella andava (risalvandola in un nuovo file)!
Quando vado ad eseguire i comandi (ovviamente rimodellando il percorso e quant'altro), mi ridà nuovamente l'output precendente.
Ho provato anche a pulire la console e a ravviare il computer..
Non sò cosa fare! Aiutatemi se potete  |
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n/a
deleted
6 Messaggi |
Inserito il - 13 gennaio 2010 : 12:15:02
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| Che sistema operativo usi e quanta ram hai? il file da caricare quanto è grande? |
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Glubus
Utente Junior
156 Messaggi |
Inserito il - 13 gennaio 2010 : 16:05:39
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Citazione:
Messaggio inserito da Pina Iannelli
Che sistema operativo usi e quanta ram hai? il file da caricare quanto è grande?
OK.
Guarda anche se R parte con un workspace pulito (fai ls() ad inizio sezione, ti ovrebbe ritornare "character(0)"). Se ci sno altri oggetti voluminosi (che R "pesca" nella working directory) rimuovili.
Poi prova a vedere quanto è grande il tuo dataset.
object.size(dati) #in bites
dim(dati)#righe e colonne
poi prova a vedere ?memory.limit
senza sapere come è strutturato o quanto è grande "dati" non è possibile dire molto di più, se non risolvi fai
str(dati) e posta il risultato.
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Warning in R: package 'rgl' is in use and will not
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