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leccis
Nuovo Arrivato
4 Messaggi |
 Inserito il - 02 febbraio 2010 : 14:54:29
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Ciao! Ho trovato questo sito cercando informazioni sulla Bioinformatica (materia su cui verrò esaminato lunedì prossimo).
Ci hanno inbottiti di nozioni e teoria ma sulla pratica non ci hanno detto praticamente nulla.
Volevo chiedervi quindi se c'è un tutorial o qualche anima pia che abbia il tempo ( e la voglia) di spiegarmi qualcosina..
Grazie,
Sandro
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james85
Nuovo Arrivato
Città: Ancona
32 Messaggi |
Inserito il - 02 febbraio 2010 : 16:55:24
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dipende da ciò che dovrai fare:
sui vari siti quali phyre,ncbi,pdb, ci sono ampie sezioni di help (rigorosamente in inglese) e ciò è presente anche nei vari programmi quali rasmol o swisspdb
poi ripeto certamente dipende dal programma dell'esame (lo devo fare anche io fra qualche settimana..) |
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leccis
Nuovo Arrivato
4 Messaggi |
Inserito il - 02 febbraio 2010 : 17:25:23
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Ma in fondo é solo una introduzione, nulla di molto specifico.
Ho comunque molta confusione riguardo chi fa cosa, o che database é più "capiente", chi più "completo"..
abbiamo fatto un po' di tutto, tra allineamenti singoli, multipli, dot-plot,.. in fondo, una volta capito il meccanismo, son facili. Solo che nei fogli che ci hanno dato é tutto incasinato e così pure nella mia testa :D
Ho cominciato a capire qualcosa usando EMBL, lalign e Blast.. ma ho ancora un po' di "vuoti" da colmare.. |
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james85
Nuovo Arrivato
Città: Ancona
32 Messaggi |
Inserito il - 02 febbraio 2010 : 17:56:00
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| per le proteine secondo me pdb è il migliore..per gli allineamenti multipli dovrei usare clustalw e blast per gli allineamenti. Userò invece phyre per le strutture terziarie |
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domi84
Moderatore
Città: Glasgow
1724 Messaggi |
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leccis
Nuovo Arrivato
4 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2010 : 10:33:41
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Grazie per le risposte;)
Comincio con la prima domanda..
Cosa sono i Fingerprints quando si parla di PSSM (position specific scoring matrix)?
grazie |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Città: Monza
1303 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2010 : 10:35:21
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| Se poi hai intenzione di proseguire nella bioinformatica io ti consiglierei caldamente di cominciare a prenderti qualche libercolo su linguaggi di programmazione tipo Perl o Python. Ho assistito a corsi dove ti spiegavano le magnificenze di BioPerl con un introduzione troppo minimale sulla programmazione. |
http://www.linkedin.com/in/dariocorrada |
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