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Iside
Utente Attivo
Città: Napoli
1375 Messaggi |
 Inserito il - 03 febbraio 2010 : 11:01:12
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chissà se è la sezione giusta
ho un problema: avrei bisogno di trovare un software che mi consenta di fare una conta automatizzata di cellule. Mi spiego meglio: all'intenro di un campo preso al microscopio, io conto le cellule che sono in mitosi dalla cellula che non lo sono e tutto questo MANUALMENTE!!! cioè con il mio bravo contacellule conto almeno 300 cellule per ogni trattamento e ogni trattamento è fatto in triplicato. per fare questo devo usare un obiettivo abbastanza stretto, tipo un 63x o, ancora meglio, un 100x. quindi in ogni campo visualizzo al massimo 10 cellule... che tragedia!!!
quello che vorrei fare io è fondamentalmente questo:
1. catturare un'immagine con un campo molto largo, magari anche con un 40x
2. usare un programmino per dire al software "conta tutte le cellule che vedi e poi sottrai al numero totale le cellule colorate diversamente"
3. fare poi manualmente i calcoli.
can someone help me? 
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chick80
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Iside
Utente Attivo
Città: Napoli
1375 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2010 : 21:21:34
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avevo già letto qualcosa riguardo l'uso di ImageJ per la conta automatizzata, ma io dovrei fare qualcosa di diverso. forse prima non mi sono espressa chiaramente, dunque, io ho un campione dove in blu sono marcati tutti i nuclei (quelli di cellule in interfase e quelli di cellule mitotiche) mentre in rosso marco solo i cromosomi di cellule mitotiche. ora, acquisendo l'immagine prima con il blu e poi con il rosso, io devo dire al software "sottrai dalla conta delle cellule blu quelle che sono anche rosse". credo che sia una cosa fattibile anche manualmente (con imageJ conto prima le cellule blu, poi quelle rosse e poi uso la calcolatrice )però volevo sapere se un software può farlo da solo...comunque grazie mille per il link, mi saranno utili  |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2010 : 22:22:46
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Non sono sicuro che si possa fare in automatico (probabilmente sì), ad ogni modo se tutte le cellule rosse sono anche blu basta fare la differenza, come hai detto tu alla fine una differenza non prende molto tempo.  |
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