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genoveffa
Nuovo Arrivato


Prov.: Avellino


25 Messaggi

Inserito il - 16 giugno 2006 : 16:19:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di genoveffa Invia a genoveffa un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao a tutti,
qualcuno potrebbe spiegarmi il metodo di sequenziamento shotgun?
grazie mille

Patrizio
Moderatore

mago

Cittā: Barcellona


1912 Messaggi

Inserito il - 16 giugno 2006 : 21:29:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Allora,vediamo se ti puo' servire questo:
COSTRUZIONE DI CONTIG DI CLONI BAC
1)Mappa di restrizione per ciascun clone BAC
2)costruzione di una mappa di contig utilizzando programmi bioinformatici
3)scelta dei cloni sequenzando il minor overlapping,ed utilizzo per il sequeziamento, a questo punto si fa il sequenziamento shotgun per ogni singolo clone,si amplifica l inserto che si deve sequenziare e mediante sonicazione si ricavano dei frammenti,si scelgono quelli di circa 300pb in modo da metterli in un vettore M13,il che permette di determinare facilmente 300 pb di sequenza,ora sempre con opportuni programmi sovrapponi queste sequenze e ricavi la sequenza intera del clone di partenza
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