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roselady
Nuovo Arrivato
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119 Messaggi |
 Inserito il - 09 febbraio 2010 : 11:40:21
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Sondaggio:
Salve a tutti ,ho a che fare con questo esercizio da giorni :S
Spero che qualcuno possa aiutarmi.
In pratica devo costruire una mappa di restrizione circolare(con plasmide quindi) .I dati sono questi :
Not I : 4000
Kpn : 3000-1000
Eco RI: 3100-900
NotI/Kpn : 3000-900-100
NotI/Eco RI : 2400-900-700
NotI/EcoRI/Kpn: 2200-800-700-200-100
Ho gia cercato nel sito qualcosa dl genere ma non ho capito proprio il procedimento,è proprio la base che non capisco uffa...qualcuno puo aiutarmi spiegandomi un po passo passo cosa bisogna fare?
Grazie mille :)
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Neuroscience
Utente
659 Messaggi |
 Inserito il - 09 febbraio 2010 : 13:00:54
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Cara Roselady,
il procedimento più semplice è procurarsi una risma di fogli di carta, una matita ed una calcolatrice.
Prendi il primo foglio, disegni un cerchio che rappresenti il plasmide.
Poi inizia ad individuare la prima situazione.
Not I : 4000 -> Una sola banda da 4.000 bp, con quanti tagli otterresti 1 solo frammento da una circonferenza? -> quindi disegni il/i siti di Not I sul 1° foglio.
Poi considera la seconda situazione
Kpn : 3000-1000 (2 bande) -> con quanti tagli otterresti 2 frammenti da una circonferenza? -> quindi disegni il/i siti di Kpn I sul 2° foglio e le loro distanze reciproche
idem per EcoR I
poi sul 4° foglio cerca di valutare quanto devono essere vicini i siti Not e Kpn per dare le tre bande riportate sulla circonferenza. Magari tra i segni di NotI e KpnI mettici la distanza in numero di basi.
idem per le altre possibilità.
Fai un po' di combinazioni e valuta di volta in volta le distanze tra i vari siti di restrizione.
La soluzione l'hai trovata quando nel vettore finale riesci a mettere tutti i siti di restrizione con le loro relative distanze reciproche e:
1. la somma di tutte le distanze dei siti è uguale alle dimensioni del vettore (4.000 basi). Infatti (1° foglio) 4.000, (2°) 3.000+1.000=4.000, (3°) 3.100+900=4.000, (4°) 3.000+900+100=4.000 etc
2. Se tagli la mappa che hai ottenuto con gli enzimi e le combinazioni suddette ti trovi i frammenti che l'esercizio ti dice.
In bocca al lupo.
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roselady
Nuovo Arrivato
Prov.: Napoli
Città: napoli
119 Messaggi |
Inserito il - 09 febbraio 2010 : 20:40:25
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| Grazie mille sei stato gentilissimo! ma quindi per la mappa circolare non ci sono quelle "regole" da considerare per la mappa lineare? tipo : vedi se nella doppia digestione c'è un frammento che compare anche nella digestione singola,se si questo frammento è delimitato dal sito di restrizione di uno stesso enzima etc etc? |
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mappa di restrizione circolare
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