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Autore

Discussione

genoveffa
Nuovo Arrivato

Prov.: Avellino

25 Messaggi

Inserito il - 26 giugno 2006 : 19:29:50

ciao a tutti
volevo sapere se qualcuno può segnalarmi qualcosa sulle
orf.
grazie

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 28 giugno 2006 : 16:22:16

Ti servono informazioni sulle ORF o su una ORF in particolare?

Nel primo caso, potresti partire banalmente dalla definizione di google:
http://www.google.it/search?hl=it&q=define%3A%22Open+reading+frame%22&btnG=Cerca&meta=lr%3Dlang_it
e poi girare un po' di wikipedie:
http://en.wikipedia.org/wiki/Open_reading_frame
http://www.biocrawler.com/encyclopedia/Open_reading_frame

Infine puoi provare qualche motore di ricerca piu' raffinato, tipo:
http://www.scirus.com/srsapp/search?q=%22open+reading+frame%22+NEAR+course&ds=nom&ds=web&g=s&t=all
http://clusty.com/search?input-form=simple-clusty&query=%22Open+reading+frame%22

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

memole
Utente Junior

Prov.: Brindisi
Città: brindisi

577 Messaggi

Inserito il - 30 giugno 2006 : 12:19:52

ciao detto in parole povere la orf o sequenza aperta di lettura è la regione presente sull'mRNA che codifica per la proteina. è caratterizzata dal codone ATG di inizio e da uno dei tre codoni di stop.questo davvero in sintesi...spero di esserti stata utile

ales
Utente Junior

Prov.: Palermo
Città: Palermo

455 Messaggi

Inserito il - 23 maggio 2007 : 23:27:19

il codone d'inizio ricordo ke è AUG

Ales

Crick82
Utente Junior

139 Messaggi

Inserito il - 24 maggio 2007 : 01:45:32

Se si ricercano le ORF sul filamento senso del DNA si cercheranno gli ATG. Se invece si cerca di capire quale parte dell'mRNA rappresenta l'ORF, allora si cercherà l'AUG.
Anche le tabelle del codice genetico a volte riportano le T, quindi si riferiscono al DNA o al cDNA ed altre volte portano le U e quindi si riferiscono all'RNA.
Ci sono programmi appositi che immessa la sequenza, permettono di trovare le ORF nei vari frame possibili. In base alla dimensione dell'ORF già si intuisce quale dovrebbe essere l'ORF che effettivamente verrà poi tradotta in proteina.