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 dati real time discordanti con western
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jovy
Nuovo Arrivato



102 Messaggi

Inserito il - 09 aprile 2010 : 19:27:08  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di jovy Invia a jovy un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao...
secondo voi è possibile che i livelli di espressione di una proteina che analizzati con real time indicano diminuzione a x giorni e risalita a y giorni, analizzati con western dicono quasi il contrario...e cioè: risalita a x giorni e risalita ancora maggiore a y giorni...
e come ve lo spieghereste?
grazie come al solito!!!
:-)

gi

GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 09 aprile 2010 : 20:35:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Beh dovresti sapere che con la real-time non analizzi i livelli di espressione della proteina ma del suo mRNA, mentre con il western blot vedi la proteina.
Quindi è possibilissimo che i risultati non combacino, è convolto tutto il processo di regolazione post-trascrizionale, di traduzione e la sua regolazione.
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SpemannOrganizer
Utente

Spemann

Città: Los Angeles


955 Messaggi

Inserito il - 09 aprile 2010 : 21:51:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di SpemannOrganizer Invia a SpemannOrganizer un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
concordo con gfpina. Dovresti anche sapere che spesso la stabilità di mRNA e proteine sono del tutto diverse: è possibile cioè che l'mRNA del gene di cui analizzi l'espressione, venga degradato e risintetizzato + o - velocemente, ma il prodotto proteico potrebbe essere più stabile ed avere quindi un turnover molto + lento.
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